Protein–RNA interactions for Protein: Q16878

CDO1, Cysteine dioxygenase type 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDO1Q16878 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
CDO1Q16878 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
CDO1Q16878 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
CDO1Q16878 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
CDO1Q16878 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
CDO1Q16878 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
CDO1Q16878 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
CDO1Q16878 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
CDO1Q16878 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
CDO1Q16878 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
CDO1Q16878 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
CDO1Q16878 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
CDO1Q16878 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
CDO1Q16878 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
CDO1Q16878 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC26.59■■□□□ 1.85
CDO1Q16878 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
CDO1Q16878 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
CDO1Q16878 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
CDO1Q16878 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
CDO1Q16878 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
CDO1Q16878 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
CDO1Q16878 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC26.58■■□□□ 1.85
CDO1Q16878 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
CDO1Q16878 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
CDO1Q16878 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
CDO1Q16878 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
CDO1Q16878 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
CDO1Q16878 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
CDO1Q16878 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
CDO1Q16878 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
CDO1Q16878 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
CDO1Q16878 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
CDO1Q16878 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
CDO1Q16878 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
CDO1Q16878 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
CDO1Q16878 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
CDO1Q16878 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
CDO1Q16878 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
CDO1Q16878 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
CDO1Q16878 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
CDO1Q16878 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
CDO1Q16878 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC26.54■■□□□ 1.84
CDO1Q16878 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC26.54■■□□□ 1.84
CDO1Q16878 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
CDO1Q16878 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
CDO1Q16878 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
CDO1Q16878 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
CDO1Q16878 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC26.52■■□□□ 1.84
CDO1Q16878 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
CDO1Q16878 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
CDO1Q16878 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
CDO1Q16878 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
CDO1Q16878 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC26.5■■□□□ 1.83
CDO1Q16878 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
CDO1Q16878 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
CDO1Q16878 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
CDO1Q16878 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
CDO1Q16878 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
CDO1Q16878 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
CDO1Q16878 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CDO1Q16878 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
CDO1Q16878 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CDO1Q16878 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
CDO1Q16878 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC26.48■■□□□ 1.83
CDO1Q16878 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CDO1Q16878 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CDO1Q16878 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CDO1Q16878 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
CDO1Q16878 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CDO1Q16878 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
CDO1Q16878 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CDO1Q16878 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
CDO1Q16878 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
CDO1Q16878 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
CDO1Q16878 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
CDO1Q16878 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
CDO1Q16878 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC26.45■■□□□ 1.82
CDO1Q16878 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
CDO1Q16878 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CDO1Q16878 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
CDO1Q16878 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
CDO1Q16878 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CDO1Q16878 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
CDO1Q16878 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
CDO1Q16878 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
CDO1Q16878 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
CDO1Q16878 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
CDO1Q16878 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
CDO1Q16878 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
CDO1Q16878 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
CDO1Q16878 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
CDO1Q16878 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
CDO1Q16878 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC26.43■■□□□ 1.82
CDO1Q16878 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC26.43■■□□□ 1.82
CDO1Q16878 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CDO1Q16878 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CDO1Q16878 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CDO1Q16878 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
CDO1Q16878 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
CDO1Q16878 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
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