Protein–RNA interactions for Protein: Q16820

MEP1B, Meprin A subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 701 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MEP1BQ16820 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
MEP1BQ16820 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
MEP1BQ16820 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
MEP1BQ16820 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
MEP1BQ16820 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
MEP1BQ16820 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
MEP1BQ16820 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
MEP1BQ16820 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
MEP1BQ16820 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
MEP1BQ16820 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
MEP1BQ16820 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
MEP1BQ16820 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
MEP1BQ16820 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
MEP1BQ16820 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
MEP1BQ16820 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
MEP1BQ16820 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
MEP1BQ16820 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
MEP1BQ16820 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
MEP1BQ16820 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
MEP1BQ16820 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
MEP1BQ16820 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
MEP1BQ16820 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
MEP1BQ16820 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
MEP1BQ16820 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
MEP1BQ16820 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
MEP1BQ16820 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
MEP1BQ16820 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
MEP1BQ16820 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
MEP1BQ16820 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
MEP1BQ16820 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
MEP1BQ16820 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC22.47■■□□□ 1.19
MEP1BQ16820 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
MEP1BQ16820 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
MEP1BQ16820 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
MEP1BQ16820 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
MEP1BQ16820 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
MEP1BQ16820 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
MEP1BQ16820 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
MEP1BQ16820 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
MEP1BQ16820 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
MEP1BQ16820 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
MEP1BQ16820 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
MEP1BQ16820 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
MEP1BQ16820 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
MEP1BQ16820 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
MEP1BQ16820 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
MEP1BQ16820 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
MEP1BQ16820 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
MEP1BQ16820 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
MEP1BQ16820 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
MEP1BQ16820 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
MEP1BQ16820 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
MEP1BQ16820 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
MEP1BQ16820 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
MEP1BQ16820 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
MEP1BQ16820 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
MEP1BQ16820 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC22.4■■□□□ 1.18
MEP1BQ16820 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
MEP1BQ16820 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
MEP1BQ16820 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
MEP1BQ16820 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
MEP1BQ16820 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
MEP1BQ16820 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
MEP1BQ16820 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
MEP1BQ16820 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
MEP1BQ16820 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
MEP1BQ16820 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
MEP1BQ16820 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
MEP1BQ16820 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
MEP1BQ16820 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
MEP1BQ16820 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
MEP1BQ16820 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
MEP1BQ16820 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
MEP1BQ16820 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
MEP1BQ16820 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
MEP1BQ16820 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
MEP1BQ16820 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
MEP1BQ16820 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
MEP1BQ16820 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
MEP1BQ16820 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
MEP1BQ16820 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
MEP1BQ16820 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
MEP1BQ16820 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
MEP1BQ16820 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
MEP1BQ16820 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
MEP1BQ16820 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
MEP1BQ16820 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MEP1BQ16820 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
MEP1BQ16820 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
MEP1BQ16820 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC22.33■■□□□ 1.17
MEP1BQ16820 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
MEP1BQ16820 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
MEP1BQ16820 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
MEP1BQ16820 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.16
MEP1BQ16820 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.16
MEP1BQ16820 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
MEP1BQ16820 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
MEP1BQ16820 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
MEP1BQ16820 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
MEP1BQ16820 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.7 ms