Protein–RNA interactions for Protein: Q16385

SSX2, Protein SSX2, humanhuman

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Length 188 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSX2Q16385 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
SSX2Q16385 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
SSX2Q16385 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
SSX2Q16385 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
SSX2Q16385 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
SSX2Q16385 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
SSX2Q16385 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
SSX2Q16385 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
SSX2Q16385 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
SSX2Q16385 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
SSX2Q16385 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
SSX2Q16385 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
SSX2Q16385 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
SSX2Q16385 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
SSX2Q16385 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
SSX2Q16385 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
SSX2Q16385 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
SSX2Q16385 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
SSX2Q16385 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
SSX2Q16385 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
SSX2Q16385 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
SSX2Q16385 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
SSX2Q16385 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
SSX2Q16385 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
SSX2Q16385 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
SSX2Q16385 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
SSX2Q16385 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
SSX2Q16385 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
SSX2Q16385 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SSX2Q16385 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SSX2Q16385 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
SSX2Q16385 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
SSX2Q16385 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SSX2Q16385 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
SSX2Q16385 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SSX2Q16385 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
SSX2Q16385 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SSX2Q16385 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
SSX2Q16385 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SSX2Q16385 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SSX2Q16385 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SSX2Q16385 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SSX2Q16385 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SSX2Q16385 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
SSX2Q16385 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SSX2Q16385 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
SSX2Q16385 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
SSX2Q16385 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SSX2Q16385 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SSX2Q16385 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
SSX2Q16385 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SSX2Q16385 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC20.77■□□□□ 0.92
SSX2Q16385 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
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SSX2Q16385 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
SSX2Q16385 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
SSX2Q16385 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
SSX2Q16385 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
SSX2Q16385 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
SSX2Q16385 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
SSX2Q16385 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
SSX2Q16385 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
SSX2Q16385 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
SSX2Q16385 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
SSX2Q16385 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC20.75■□□□□ 0.91
SSX2Q16385 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
SSX2Q16385 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
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SSX2Q16385 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
SSX2Q16385 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
SSX2Q16385 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
SSX2Q16385 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
SSX2Q16385 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
SSX2Q16385 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
SSX2Q16385 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
SSX2Q16385 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
SSX2Q16385 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
SSX2Q16385 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
SSX2Q16385 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
SSX2Q16385 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
SSX2Q16385 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC20.73■□□□□ 0.91
SSX2Q16385 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
SSX2Q16385 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
SSX2Q16385 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
SSX2Q16385 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
SSX2Q16385 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
SSX2Q16385 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
SSX2Q16385 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
SSX2Q16385 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
SSX2Q16385 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC20.72■□□□□ 0.91
SSX2Q16385 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
SSX2Q16385 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
SSX2Q16385 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
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