Protein–RNA interactions for Protein: Q13114

TRAF3, TNF receptor-associated factor 3, humanhuman

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Length 568 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF3Q13114 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
TRAF3Q13114 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TRAF3Q13114 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
TRAF3Q13114 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
TRAF3Q13114 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TRAF3Q13114 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
TRAF3Q13114 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
TRAF3Q13114 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TRAF3Q13114 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TRAF3Q13114 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
TRAF3Q13114 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TRAF3Q13114 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
TRAF3Q13114 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
TRAF3Q13114 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
TRAF3Q13114 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
TRAF3Q13114 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TRAF3Q13114 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
TRAF3Q13114 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TRAF3Q13114 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TRAF3Q13114 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
TRAF3Q13114 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
TRAF3Q13114 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
TRAF3Q13114 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
TRAF3Q13114 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
TRAF3Q13114 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TRAF3Q13114 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TRAF3Q13114 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TRAF3Q13114 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TRAF3Q13114 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TRAF3Q13114 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TRAF3Q13114 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TRAF3Q13114 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TRAF3Q13114 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TRAF3Q13114 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TRAF3Q13114 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TRAF3Q13114 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TRAF3Q13114 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TRAF3Q13114 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TRAF3Q13114 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC24.55■■□□□ 1.52
TRAF3Q13114 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
TRAF3Q13114 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TRAF3Q13114 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
TRAF3Q13114 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TRAF3Q13114 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TRAF3Q13114 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
TRAF3Q13114 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TRAF3Q13114 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TRAF3Q13114 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TRAF3Q13114 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TRAF3Q13114 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
TRAF3Q13114 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TRAF3Q13114 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
TRAF3Q13114 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TRAF3Q13114 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TRAF3Q13114 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TRAF3Q13114 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TRAF3Q13114 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
TRAF3Q13114 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TRAF3Q13114 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TRAF3Q13114 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TRAF3Q13114 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TRAF3Q13114 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TRAF3Q13114 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TRAF3Q13114 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TRAF3Q13114 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TRAF3Q13114 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TRAF3Q13114 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TRAF3Q13114 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TRAF3Q13114 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TRAF3Q13114 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
TRAF3Q13114 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TRAF3Q13114 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TRAF3Q13114 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TRAF3Q13114 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
TRAF3Q13114 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TRAF3Q13114 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TRAF3Q13114 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TRAF3Q13114 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TRAF3Q13114 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TRAF3Q13114 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
TRAF3Q13114 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
TRAF3Q13114 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TRAF3Q13114 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TRAF3Q13114 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
TRAF3Q13114 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
TRAF3Q13114 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
TRAF3Q13114 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TRAF3Q13114 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
TRAF3Q13114 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TRAF3Q13114 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
TRAF3Q13114 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TRAF3Q13114 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TRAF3Q13114 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TRAF3Q13114 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TRAF3Q13114 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TRAF3Q13114 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TRAF3Q13114 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TRAF3Q13114 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TRAF3Q13114 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TRAF3Q13114 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
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