Protein–RNA interactions for Protein: Q08722

CD47, Leukocyte surface antigen CD47, humanhuman

Predictions only

Length 323 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD47Q08722 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
CD47Q08722 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CD47Q08722 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CD47Q08722 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CD47Q08722 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CD47Q08722 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CD47Q08722 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CD47Q08722 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CD47Q08722 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CD47Q08722 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CD47Q08722 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CD47Q08722 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CD47Q08722 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CD47Q08722 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CD47Q08722 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CD47Q08722 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
CD47Q08722 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CD47Q08722 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CD47Q08722 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CD47Q08722 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CD47Q08722 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CD47Q08722 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CD47Q08722 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CD47Q08722 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CD47Q08722 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CD47Q08722 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CD47Q08722 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CD47Q08722 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CD47Q08722 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CD47Q08722 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CD47Q08722 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CD47Q08722 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CD47Q08722 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CD47Q08722 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
CD47Q08722 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CD47Q08722 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CD47Q08722 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CD47Q08722 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CD47Q08722 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CD47Q08722 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CD47Q08722 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CD47Q08722 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CD47Q08722 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CD47Q08722 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CD47Q08722 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CD47Q08722 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CD47Q08722 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CD47Q08722 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CD47Q08722 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CD47Q08722 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CD47Q08722 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CD47Q08722 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CD47Q08722 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CD47Q08722 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CD47Q08722 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CD47Q08722 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CD47Q08722 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
CD47Q08722 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
CD47Q08722 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CD47Q08722 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CD47Q08722 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CD47Q08722 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CD47Q08722 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CD47Q08722 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CD47Q08722 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CD47Q08722 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CD47Q08722 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CD47Q08722 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CD47Q08722 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
CD47Q08722 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CD47Q08722 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CD47Q08722 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CD47Q08722 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
CD47Q08722 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CD47Q08722 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CD47Q08722 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CD47Q08722 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CD47Q08722 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CD47Q08722 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CD47Q08722 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CD47Q08722 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CD47Q08722 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CD47Q08722 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CD47Q08722 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CD47Q08722 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CD47Q08722 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
CD47Q08722 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CD47Q08722 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CD47Q08722 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CD47Q08722 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CD47Q08722 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CD47Q08722 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CD47Q08722 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CD47Q08722 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CD47Q08722 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CD47Q08722 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CD47Q08722 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CD47Q08722 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CD47Q08722 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CD47Q08722 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.9 ms