Protein–RNA interactions for Protein: Q07627

KRTAP1-1, Keratin-associated protein 1-1, humanhuman

Predictions only

Length 177 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP1-1Q07627 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
KRTAP1-1Q07627 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
KRTAP1-1Q07627 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
KRTAP1-1Q07627 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
KRTAP1-1Q07627 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
KRTAP1-1Q07627 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
KRTAP1-1Q07627 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
KRTAP1-1Q07627 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
KRTAP1-1Q07627 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
KRTAP1-1Q07627 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
KRTAP1-1Q07627 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
KRTAP1-1Q07627 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
KRTAP1-1Q07627 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
KRTAP1-1Q07627 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
KRTAP1-1Q07627 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
KRTAP1-1Q07627 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC21.06■□□□□ 0.96
KRTAP1-1Q07627 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
KRTAP1-1Q07627 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
KRTAP1-1Q07627 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
KRTAP1-1Q07627 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
KRTAP1-1Q07627 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
KRTAP1-1Q07627 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
KRTAP1-1Q07627 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
KRTAP1-1Q07627 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
KRTAP1-1Q07627 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
KRTAP1-1Q07627 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
KRTAP1-1Q07627 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
KRTAP1-1Q07627 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
KRTAP1-1Q07627 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
KRTAP1-1Q07627 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
KRTAP1-1Q07627 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC21.04■□□□□ 0.96
KRTAP1-1Q07627 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
KRTAP1-1Q07627 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
KRTAP1-1Q07627 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
KRTAP1-1Q07627 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
KRTAP1-1Q07627 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC21.03■□□□□ 0.96
KRTAP1-1Q07627 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
KRTAP1-1Q07627 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
KRTAP1-1Q07627 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
KRTAP1-1Q07627 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
KRTAP1-1Q07627 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
KRTAP1-1Q07627 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
KRTAP1-1Q07627 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
KRTAP1-1Q07627 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
KRTAP1-1Q07627 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
KRTAP1-1Q07627 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
KRTAP1-1Q07627 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
KRTAP1-1Q07627 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
KRTAP1-1Q07627 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
KRTAP1-1Q07627 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
KRTAP1-1Q07627 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
KRTAP1-1Q07627 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
KRTAP1-1Q07627 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
KRTAP1-1Q07627 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
KRTAP1-1Q07627 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
KRTAP1-1Q07627 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
KRTAP1-1Q07627 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
KRTAP1-1Q07627 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
KRTAP1-1Q07627 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
KRTAP1-1Q07627 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
KRTAP1-1Q07627 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
KRTAP1-1Q07627 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
KRTAP1-1Q07627 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
KRTAP1-1Q07627 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
KRTAP1-1Q07627 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
KRTAP1-1Q07627 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
KRTAP1-1Q07627 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
KRTAP1-1Q07627 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC20.95■□□□□ 0.94
KRTAP1-1Q07627 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
KRTAP1-1Q07627 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
KRTAP1-1Q07627 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
KRTAP1-1Q07627 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
KRTAP1-1Q07627 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
KRTAP1-1Q07627 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
KRTAP1-1Q07627 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
KRTAP1-1Q07627 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
KRTAP1-1Q07627 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
KRTAP1-1Q07627 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
KRTAP1-1Q07627 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
KRTAP1-1Q07627 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
KRTAP1-1Q07627 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
KRTAP1-1Q07627 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
KRTAP1-1Q07627 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
KRTAP1-1Q07627 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
KRTAP1-1Q07627 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
KRTAP1-1Q07627 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
KRTAP1-1Q07627 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
KRTAP1-1Q07627 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
KRTAP1-1Q07627 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
KRTAP1-1Q07627 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
KRTAP1-1Q07627 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
KRTAP1-1Q07627 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
KRTAP1-1Q07627 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
KRTAP1-1Q07627 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
KRTAP1-1Q07627 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
KRTAP1-1Q07627 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
KRTAP1-1Q07627 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
KRTAP1-1Q07627 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
KRTAP1-1Q07627 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
KRTAP1-1Q07627 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.9 ms