Protein–RNA interactions for Protein: Q07002

CDK18, Cyclin-dependent kinase 18, humanhuman

Predictions only

Length 472 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK18Q07002 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CDK18Q07002 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CDK18Q07002 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CDK18Q07002 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CDK18Q07002 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CDK18Q07002 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CDK18Q07002 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
CDK18Q07002 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CDK18Q07002 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CDK18Q07002 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CDK18Q07002 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
CDK18Q07002 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CDK18Q07002 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CDK18Q07002 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CDK18Q07002 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CDK18Q07002 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CDK18Q07002 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CDK18Q07002 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CDK18Q07002 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CDK18Q07002 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CDK18Q07002 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CDK18Q07002 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CDK18Q07002 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CDK18Q07002 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CDK18Q07002 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
CDK18Q07002 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CDK18Q07002 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CDK18Q07002 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CDK18Q07002 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CDK18Q07002 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CDK18Q07002 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CDK18Q07002 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
CDK18Q07002 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
CDK18Q07002 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CDK18Q07002 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CDK18Q07002 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CDK18Q07002 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CDK18Q07002 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CDK18Q07002 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CDK18Q07002 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CDK18Q07002 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
CDK18Q07002 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CDK18Q07002 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CDK18Q07002 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CDK18Q07002 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CDK18Q07002 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CDK18Q07002 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CDK18Q07002 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CDK18Q07002 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CDK18Q07002 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CDK18Q07002 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CDK18Q07002 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
CDK18Q07002 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
CDK18Q07002 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC25.7■■□□□ 1.7
CDK18Q07002 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CDK18Q07002 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CDK18Q07002 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CDK18Q07002 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CDK18Q07002 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CDK18Q07002 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CDK18Q07002 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CDK18Q07002 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
CDK18Q07002 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CDK18Q07002 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CDK18Q07002 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CDK18Q07002 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CDK18Q07002 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CDK18Q07002 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
CDK18Q07002 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CDK18Q07002 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
CDK18Q07002 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CDK18Q07002 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CDK18Q07002 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CDK18Q07002 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CDK18Q07002 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CDK18Q07002 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CDK18Q07002 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CDK18Q07002 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
CDK18Q07002 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
CDK18Q07002 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
CDK18Q07002 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
CDK18Q07002 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
CDK18Q07002 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
CDK18Q07002 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
CDK18Q07002 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CDK18Q07002 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CDK18Q07002 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CDK18Q07002 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CDK18Q07002 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CDK18Q07002 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CDK18Q07002 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CDK18Q07002 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CDK18Q07002 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CDK18Q07002 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CDK18Q07002 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
CDK18Q07002 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
CDK18Q07002 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
CDK18Q07002 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
CDK18Q07002 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
CDK18Q07002 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.9 ms