Protein–RNA interactions for Protein: Q04323

UBXN1, UBX domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 297 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN1Q04323 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
UBXN1Q04323 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
UBXN1Q04323 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
UBXN1Q04323 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
UBXN1Q04323 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
UBXN1Q04323 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC27.77■■■□□ 2.04
UBXN1Q04323 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
UBXN1Q04323 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
UBXN1Q04323 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
UBXN1Q04323 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
UBXN1Q04323 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
UBXN1Q04323 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC27.75■■■□□ 2.03
UBXN1Q04323 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
UBXN1Q04323 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC27.75■■■□□ 2.03
UBXN1Q04323 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
UBXN1Q04323 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
UBXN1Q04323 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
UBXN1Q04323 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
UBXN1Q04323 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
UBXN1Q04323 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
UBXN1Q04323 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
UBXN1Q04323 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC27.73■■■□□ 2.03
UBXN1Q04323 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
UBXN1Q04323 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
UBXN1Q04323 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
UBXN1Q04323 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
UBXN1Q04323 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
UBXN1Q04323 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
UBXN1Q04323 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
UBXN1Q04323 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
UBXN1Q04323 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
UBXN1Q04323 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
UBXN1Q04323 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
UBXN1Q04323 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
UBXN1Q04323 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
UBXN1Q04323 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
UBXN1Q04323 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
UBXN1Q04323 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
UBXN1Q04323 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
UBXN1Q04323 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
UBXN1Q04323 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
UBXN1Q04323 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
UBXN1Q04323 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
UBXN1Q04323 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
UBXN1Q04323 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
UBXN1Q04323 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
UBXN1Q04323 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
UBXN1Q04323 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
UBXN1Q04323 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
UBXN1Q04323 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
UBXN1Q04323 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
UBXN1Q04323 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
UBXN1Q04323 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
UBXN1Q04323 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
UBXN1Q04323 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
UBXN1Q04323 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
UBXN1Q04323 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
UBXN1Q04323 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
UBXN1Q04323 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
UBXN1Q04323 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
UBXN1Q04323 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
UBXN1Q04323 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
UBXN1Q04323 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
UBXN1Q04323 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
UBXN1Q04323 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
UBXN1Q04323 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
UBXN1Q04323 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
UBXN1Q04323 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
UBXN1Q04323 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
UBXN1Q04323 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
UBXN1Q04323 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
UBXN1Q04323 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
UBXN1Q04323 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
UBXN1Q04323 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
UBXN1Q04323 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
UBXN1Q04323 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
UBXN1Q04323 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
UBXN1Q04323 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC27.58■■■□□ 2.01
UBXN1Q04323 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC27.58■■■□□ 2.01
UBXN1Q04323 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
UBXN1Q04323 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
UBXN1Q04323 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
UBXN1Q04323 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
UBXN1Q04323 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
UBXN1Q04323 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
UBXN1Q04323 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
UBXN1Q04323 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
UBXN1Q04323 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
UBXN1Q04323 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
UBXN1Q04323 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
UBXN1Q04323 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
UBXN1Q04323 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
UBXN1Q04323 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
UBXN1Q04323 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
UBXN1Q04323 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
UBXN1Q04323 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
UBXN1Q04323 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
UBXN1Q04323 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
UBXN1Q04323 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
UBXN1Q04323 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.2 ms