Protein–RNA interactions for Protein: P84022

SMAD3, Mothers against decapentaplegic homolog 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD3P84022 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
SMAD3P84022 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
SMAD3P84022 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC27.88■■■□□ 2.05
SMAD3P84022 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
SMAD3P84022 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
SMAD3P84022 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
SMAD3P84022 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
SMAD3P84022 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
SMAD3P84022 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
SMAD3P84022 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
SMAD3P84022 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
SMAD3P84022 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
SMAD3P84022 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
SMAD3P84022 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
SMAD3P84022 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
SMAD3P84022 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
SMAD3P84022 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
SMAD3P84022 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC27.81■■■□□ 2.04
SMAD3P84022 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
SMAD3P84022 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
SMAD3P84022 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC27.81■■■□□ 2.04
SMAD3P84022 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
SMAD3P84022 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
SMAD3P84022 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
SMAD3P84022 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
SMAD3P84022 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
SMAD3P84022 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
SMAD3P84022 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
SMAD3P84022 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
SMAD3P84022 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.78■■■□□ 2.04
SMAD3P84022 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
SMAD3P84022 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
SMAD3P84022 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
SMAD3P84022 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
SMAD3P84022 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
SMAD3P84022 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
SMAD3P84022 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
SMAD3P84022 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.77■■■□□ 2.04
SMAD3P84022 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
SMAD3P84022 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
SMAD3P84022 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
SMAD3P84022 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
SMAD3P84022 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
SMAD3P84022 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
SMAD3P84022 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
SMAD3P84022 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
SMAD3P84022 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.74■■■□□ 2.03
SMAD3P84022 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
SMAD3P84022 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
SMAD3P84022 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
SMAD3P84022 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
SMAD3P84022 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
SMAD3P84022 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
SMAD3P84022 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
SMAD3P84022 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
SMAD3P84022 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
SMAD3P84022 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
SMAD3P84022 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
SMAD3P84022 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
SMAD3P84022 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
SMAD3P84022 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
SMAD3P84022 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
SMAD3P84022 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
SMAD3P84022 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
SMAD3P84022 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
SMAD3P84022 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
SMAD3P84022 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
SMAD3P84022 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
SMAD3P84022 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
SMAD3P84022 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
SMAD3P84022 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
SMAD3P84022 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
SMAD3P84022 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
SMAD3P84022 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
SMAD3P84022 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
SMAD3P84022 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
SMAD3P84022 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
SMAD3P84022 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
SMAD3P84022 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
SMAD3P84022 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC27.66■■■□□ 2.02
SMAD3P84022 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
SMAD3P84022 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
SMAD3P84022 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
SMAD3P84022 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC27.65■■■□□ 2.02
SMAD3P84022 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.64■■■□□ 2.02
SMAD3P84022 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
SMAD3P84022 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC27.64■■■□□ 2.02
SMAD3P84022 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
SMAD3P84022 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
SMAD3P84022 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
SMAD3P84022 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
SMAD3P84022 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC27.64■■■□□ 2.01
SMAD3P84022 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
SMAD3P84022 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
SMAD3P84022 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.63■■■□□ 2.01
SMAD3P84022 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
SMAD3P84022 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
SMAD3P84022 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
SMAD3P84022 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
SMAD3P84022 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.8 ms