Protein–RNA interactions for Protein: P63132

HERVK_113, Endogenous retrovirus group K member 113 Pol protein, humanhuman

Predictions only

Length 956 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERVK_113P63132 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
HERVK_113P63132 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
HERVK_113P63132 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
HERVK_113P63132 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
HERVK_113P63132 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
HERVK_113P63132 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
HERVK_113P63132 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
HERVK_113P63132 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
HERVK_113P63132 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
HERVK_113P63132 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
HERVK_113P63132 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
HERVK_113P63132 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
HERVK_113P63132 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
HERVK_113P63132 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
HERVK_113P63132 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
HERVK_113P63132 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
HERVK_113P63132 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
HERVK_113P63132 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
HERVK_113P63132 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
HERVK_113P63132 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
HERVK_113P63132 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
HERVK_113P63132 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
HERVK_113P63132 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
HERVK_113P63132 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
HERVK_113P63132 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
HERVK_113P63132 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC24.78■■□□□ 1.56
HERVK_113P63132 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
HERVK_113P63132 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
HERVK_113P63132 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
HERVK_113P63132 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
HERVK_113P63132 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
HERVK_113P63132 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
HERVK_113P63132 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
HERVK_113P63132 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
HERVK_113P63132 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
HERVK_113P63132 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
HERVK_113P63132 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
HERVK_113P63132 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
HERVK_113P63132 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
HERVK_113P63132 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
HERVK_113P63132 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
HERVK_113P63132 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
HERVK_113P63132 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
HERVK_113P63132 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
HERVK_113P63132 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
HERVK_113P63132 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
HERVK_113P63132 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
HERVK_113P63132 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
HERVK_113P63132 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
HERVK_113P63132 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
HERVK_113P63132 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
HERVK_113P63132 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
HERVK_113P63132 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
HERVK_113P63132 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
HERVK_113P63132 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
HERVK_113P63132 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
HERVK_113P63132 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
HERVK_113P63132 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
HERVK_113P63132 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
HERVK_113P63132 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
HERVK_113P63132 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
HERVK_113P63132 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
HERVK_113P63132 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
HERVK_113P63132 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
HERVK_113P63132 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
HERVK_113P63132 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
HERVK_113P63132 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
HERVK_113P63132 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
HERVK_113P63132 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
HERVK_113P63132 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
HERVK_113P63132 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
HERVK_113P63132 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
HERVK_113P63132 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
HERVK_113P63132 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
HERVK_113P63132 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
HERVK_113P63132 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.66■■□□□ 1.54
HERVK_113P63132 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.66■■□□□ 1.54
HERVK_113P63132 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
HERVK_113P63132 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
HERVK_113P63132 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
HERVK_113P63132 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
HERVK_113P63132 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
HERVK_113P63132 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
HERVK_113P63132 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
HERVK_113P63132 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
HERVK_113P63132 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
HERVK_113P63132 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
HERVK_113P63132 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
HERVK_113P63132 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
HERVK_113P63132 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
HERVK_113P63132 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC24.61■■□□□ 1.53
HERVK_113P63132 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC24.61■■□□□ 1.53
HERVK_113P63132 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
HERVK_113P63132 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
HERVK_113P63132 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
HERVK_113P63132 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
HERVK_113P63132 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
HERVK_113P63132 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
HERVK_113P63132 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
HERVK_113P63132 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 83.6 ms