Protein–RNA interactions for Protein: P61758

VBP1, Prefoldin subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 197 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VBP1P61758 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
VBP1P61758 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
VBP1P61758 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
VBP1P61758 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
VBP1P61758 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
VBP1P61758 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
VBP1P61758 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
VBP1P61758 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
VBP1P61758 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
VBP1P61758 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
VBP1P61758 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
VBP1P61758 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
VBP1P61758 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
VBP1P61758 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
VBP1P61758 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
VBP1P61758 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
VBP1P61758 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
VBP1P61758 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
VBP1P61758 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
VBP1P61758 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
VBP1P61758 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
VBP1P61758 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
VBP1P61758 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
VBP1P61758 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
VBP1P61758 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
VBP1P61758 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
VBP1P61758 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
VBP1P61758 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
VBP1P61758 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
VBP1P61758 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
VBP1P61758 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
VBP1P61758 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
VBP1P61758 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
VBP1P61758 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
VBP1P61758 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
VBP1P61758 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
VBP1P61758 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
VBP1P61758 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
VBP1P61758 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
VBP1P61758 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
VBP1P61758 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
VBP1P61758 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
VBP1P61758 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
VBP1P61758 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
VBP1P61758 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
VBP1P61758 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
VBP1P61758 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
VBP1P61758 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
VBP1P61758 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
VBP1P61758 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
VBP1P61758 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
VBP1P61758 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
VBP1P61758 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
VBP1P61758 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
VBP1P61758 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
VBP1P61758 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
VBP1P61758 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
VBP1P61758 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
VBP1P61758 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
VBP1P61758 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
VBP1P61758 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
VBP1P61758 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
VBP1P61758 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
VBP1P61758 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
VBP1P61758 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
VBP1P61758 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
VBP1P61758 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
VBP1P61758 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
VBP1P61758 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
VBP1P61758 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
VBP1P61758 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
VBP1P61758 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
VBP1P61758 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
VBP1P61758 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
VBP1P61758 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
VBP1P61758 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
VBP1P61758 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
VBP1P61758 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
VBP1P61758 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
VBP1P61758 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
VBP1P61758 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
VBP1P61758 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
VBP1P61758 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
VBP1P61758 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
VBP1P61758 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
VBP1P61758 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
VBP1P61758 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
VBP1P61758 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
VBP1P61758 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
VBP1P61758 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
VBP1P61758 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
VBP1P61758 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
VBP1P61758 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
VBP1P61758 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
VBP1P61758 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
VBP1P61758 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
VBP1P61758 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
VBP1P61758 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
VBP1P61758 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
VBP1P61758 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78.5 ms