Protein–RNA interactions for Protein: P57721

PCBP3, Poly(rC)-binding protein 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 371 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCBP3P57721 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PCBP3P57721 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PCBP3P57721 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PCBP3P57721 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PCBP3P57721 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PCBP3P57721 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PCBP3P57721 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PCBP3P57721 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PCBP3P57721 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PCBP3P57721 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PCBP3P57721 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PCBP3P57721 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PCBP3P57721 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PCBP3P57721 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
PCBP3P57721 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC23.58■■□□□ 1.36
PCBP3P57721 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
PCBP3P57721 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PCBP3P57721 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PCBP3P57721 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PCBP3P57721 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PCBP3P57721 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PCBP3P57721 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
PCBP3P57721 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
PCBP3P57721 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PCBP3P57721 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PCBP3P57721 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PCBP3P57721 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PCBP3P57721 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
PCBP3P57721 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PCBP3P57721 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PCBP3P57721 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PCBP3P57721 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PCBP3P57721 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PCBP3P57721 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PCBP3P57721 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
PCBP3P57721 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PCBP3P57721 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PCBP3P57721 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PCBP3P57721 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PCBP3P57721 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PCBP3P57721 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PCBP3P57721 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PCBP3P57721 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PCBP3P57721 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PCBP3P57721 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
PCBP3P57721 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PCBP3P57721 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PCBP3P57721 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PCBP3P57721 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PCBP3P57721 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PCBP3P57721 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PCBP3P57721 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PCBP3P57721 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PCBP3P57721 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PCBP3P57721 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PCBP3P57721 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PCBP3P57721 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PCBP3P57721 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PCBP3P57721 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PCBP3P57721 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PCBP3P57721 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PCBP3P57721 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PCBP3P57721 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
PCBP3P57721 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PCBP3P57721 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PCBP3P57721 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PCBP3P57721 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PCBP3P57721 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PCBP3P57721 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PCBP3P57721 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PCBP3P57721 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PCBP3P57721 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PCBP3P57721 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PCBP3P57721 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PCBP3P57721 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
PCBP3P57721 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PCBP3P57721 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PCBP3P57721 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PCBP3P57721 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PCBP3P57721 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PCBP3P57721 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PCBP3P57721 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PCBP3P57721 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PCBP3P57721 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PCBP3P57721 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PCBP3P57721 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
PCBP3P57721 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PCBP3P57721 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PCBP3P57721 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PCBP3P57721 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PCBP3P57721 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PCBP3P57721 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PCBP3P57721 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PCBP3P57721 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PCBP3P57721 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PCBP3P57721 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PCBP3P57721 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PCBP3P57721 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PCBP3P57721 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PCBP3P57721 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 204.2 ms