Protein–RNA interactions for Protein: P54277

PMS1, PMS1 protein homolog 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 932 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMS1P54277 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
PMS1P54277 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC28.06■■■□□ 2.08
PMS1P54277 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
PMS1P54277 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
PMS1P54277 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
PMS1P54277 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
PMS1P54277 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
PMS1P54277 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
PMS1P54277 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
PMS1P54277 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
PMS1P54277 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
PMS1P54277 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
PMS1P54277 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
PMS1P54277 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
PMS1P54277 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
PMS1P54277 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC28.01■■■□□ 2.07
PMS1P54277 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
PMS1P54277 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
PMS1P54277 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
PMS1P54277 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
PMS1P54277 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
PMS1P54277 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
PMS1P54277 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
PMS1P54277 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC27.99■■■□□ 2.07
PMS1P54277 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
PMS1P54277 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC27.99■■■□□ 2.07
PMS1P54277 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
PMS1P54277 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC27.99■■■□□ 2.07
PMS1P54277 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
PMS1P54277 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
PMS1P54277 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
PMS1P54277 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
PMS1P54277 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
PMS1P54277 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC27.98■■■□□ 2.07
PMS1P54277 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
PMS1P54277 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC27.98■■■□□ 2.07
PMS1P54277 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC27.98■■■□□ 2.07
PMS1P54277 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
PMS1P54277 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
PMS1P54277 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
PMS1P54277 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
PMS1P54277 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
PMS1P54277 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
PMS1P54277 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
PMS1P54277 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
PMS1P54277 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
PMS1P54277 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC27.95■■■□□ 2.06
PMS1P54277 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
PMS1P54277 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
PMS1P54277 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
PMS1P54277 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
PMS1P54277 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
PMS1P54277 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
PMS1P54277 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
PMS1P54277 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
PMS1P54277 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
PMS1P54277 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
PMS1P54277 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
PMS1P54277 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
PMS1P54277 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
PMS1P54277 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC27.91■■■□□ 2.06
PMS1P54277 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
PMS1P54277 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
PMS1P54277 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
PMS1P54277 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
PMS1P54277 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
PMS1P54277 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
PMS1P54277 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
PMS1P54277 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
PMS1P54277 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
PMS1P54277 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
PMS1P54277 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
PMS1P54277 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
PMS1P54277 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
PMS1P54277 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
PMS1P54277 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
PMS1P54277 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
PMS1P54277 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
PMS1P54277 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
PMS1P54277 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC27.85■■■□□ 2.05
PMS1P54277 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
PMS1P54277 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
PMS1P54277 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
PMS1P54277 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
PMS1P54277 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
PMS1P54277 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
PMS1P54277 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
PMS1P54277 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
PMS1P54277 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.04
PMS1P54277 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.04
PMS1P54277 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC27.82■■■□□ 2.04
PMS1P54277 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC27.82■■■□□ 2.04
PMS1P54277 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
PMS1P54277 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
PMS1P54277 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
PMS1P54277 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
PMS1P54277 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
PMS1P54277 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
PMS1P54277 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
PMS1P54277 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.3 ms