Protein–RNA interactions for Protein: P52306

RAP1GDS1, Rap1 GTPase-GDP dissociation stimulator 1, humanhuman

Predictions only

Length 607 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAP1GDS1P52306 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
RAP1GDS1P52306 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
RAP1GDS1P52306 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
RAP1GDS1P52306 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
RAP1GDS1P52306 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
RAP1GDS1P52306 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
RAP1GDS1P52306 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
RAP1GDS1P52306 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
RAP1GDS1P52306 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
RAP1GDS1P52306 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
RAP1GDS1P52306 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
RAP1GDS1P52306 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
RAP1GDS1P52306 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
RAP1GDS1P52306 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
RAP1GDS1P52306 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
RAP1GDS1P52306 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
RAP1GDS1P52306 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
RAP1GDS1P52306 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
RAP1GDS1P52306 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
RAP1GDS1P52306 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
RAP1GDS1P52306 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
RAP1GDS1P52306 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC24.89■■□□□ 1.58
RAP1GDS1P52306 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
RAP1GDS1P52306 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
RAP1GDS1P52306 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
RAP1GDS1P52306 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC24.88■■□□□ 1.57
RAP1GDS1P52306 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
RAP1GDS1P52306 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
RAP1GDS1P52306 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
RAP1GDS1P52306 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
RAP1GDS1P52306 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
RAP1GDS1P52306 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
RAP1GDS1P52306 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
RAP1GDS1P52306 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
RAP1GDS1P52306 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
RAP1GDS1P52306 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
RAP1GDS1P52306 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
RAP1GDS1P52306 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
RAP1GDS1P52306 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
RAP1GDS1P52306 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
RAP1GDS1P52306 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
RAP1GDS1P52306 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
RAP1GDS1P52306 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
RAP1GDS1P52306 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
RAP1GDS1P52306 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
RAP1GDS1P52306 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
RAP1GDS1P52306 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
RAP1GDS1P52306 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
RAP1GDS1P52306 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
RAP1GDS1P52306 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
RAP1GDS1P52306 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
RAP1GDS1P52306 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
RAP1GDS1P52306 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
RAP1GDS1P52306 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
RAP1GDS1P52306 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
RAP1GDS1P52306 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
RAP1GDS1P52306 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
RAP1GDS1P52306 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
RAP1GDS1P52306 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
RAP1GDS1P52306 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
RAP1GDS1P52306 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
RAP1GDS1P52306 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
RAP1GDS1P52306 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
RAP1GDS1P52306 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
RAP1GDS1P52306 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
RAP1GDS1P52306 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
RAP1GDS1P52306 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
RAP1GDS1P52306 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
RAP1GDS1P52306 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
RAP1GDS1P52306 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
RAP1GDS1P52306 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
RAP1GDS1P52306 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
RAP1GDS1P52306 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
RAP1GDS1P52306 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
RAP1GDS1P52306 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
RAP1GDS1P52306 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
RAP1GDS1P52306 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
RAP1GDS1P52306 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
RAP1GDS1P52306 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
RAP1GDS1P52306 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
RAP1GDS1P52306 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
RAP1GDS1P52306 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
RAP1GDS1P52306 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
RAP1GDS1P52306 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
RAP1GDS1P52306 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
RAP1GDS1P52306 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
RAP1GDS1P52306 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
RAP1GDS1P52306 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
RAP1GDS1P52306 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
RAP1GDS1P52306 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
RAP1GDS1P52306 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
RAP1GDS1P52306 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
RAP1GDS1P52306 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
RAP1GDS1P52306 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
RAP1GDS1P52306 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
RAP1GDS1P52306 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
RAP1GDS1P52306 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
RAP1GDS1P52306 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
RAP1GDS1P52306 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
RAP1GDS1P52306 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 98.4 ms