Protein–RNA interactions for Protein: P48681

NES, Nestin, humanhuman

Predictions only

Length 1,621 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NESP48681 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC45.3■■■■■ 4.84
NESP48681 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC45.3■■■■■ 4.84
NESP48681 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC45.3■■■■■ 4.84
NESP48681 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.3■■■■■ 4.84
NESP48681 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC45.3■■■■■ 4.84
NESP48681 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC45.29■■■■■ 4.84
NESP48681 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC45.29■■■■■ 4.84
NESP48681 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC45.28■■■■■ 4.84
NESP48681 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC45.28■■■■■ 4.84
NESP48681 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC45.27■■■■■ 4.84
NESP48681 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC45.27■■■■■ 4.84
NESP48681 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC45.27■■■■■ 4.84
NESP48681 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC45.27■■■■■ 4.84
NESP48681 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.26■■■■■ 4.84
NESP48681 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC45.26■■■■■ 4.84
NESP48681 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.25■■■■■ 4.83
NESP48681 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC45.24■■■■■ 4.83
NESP48681 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.23■■■■■ 4.83
NESP48681 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC45.23■■■■■ 4.83
NESP48681 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC45.22■■■■■ 4.83
NESP48681 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.21■■■■■ 4.83
NESP48681 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC45.21■■■■■ 4.83
NESP48681 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC45.21■■■■■ 4.83
NESP48681 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC45.2■■■■■ 4.83
NESP48681 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC45.2■■■■■ 4.83
NESP48681 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC45.2■■■■■ 4.83
NESP48681 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC45.2■■■■■ 4.83
NESP48681 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC45.2■■■■■ 4.83
NESP48681 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC45.2■■■■■ 4.83
NESP48681 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC45.2■■■■■ 4.83
NESP48681 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC45.2■■■■■ 4.83
NESP48681 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC45.19■■■■■ 4.82
NESP48681 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.18■■■■■ 4.82
NESP48681 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC45.18■■■■■ 4.82
NESP48681 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC45.18■■■■■ 4.82
NESP48681 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC45.18■■■■■ 4.82
NESP48681 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.17■■■■■ 4.82
NESP48681 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC45.17■■■■■ 4.82
NESP48681 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC45.17■■■■■ 4.82
NESP48681 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC45.16■■■■■ 4.82
NESP48681 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.16■■■■■ 4.82
NESP48681 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC45.16■■■■■ 4.82
NESP48681 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.16■■■■■ 4.82
NESP48681 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.16■■■■■ 4.82
NESP48681 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.16■■■■■ 4.82
NESP48681 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC45.15■■■■■ 4.82
NESP48681 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.15■■■■■ 4.82
NESP48681 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC45.15■■■■■ 4.82
NESP48681 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC45.15■■■■■ 4.82
NESP48681 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC45.15■■■■■ 4.82
NESP48681 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC45.14■■■■■ 4.82
NESP48681 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC45.14■■■■■ 4.82
NESP48681 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.13■■■■■ 4.82
NESP48681 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC45.12■■■■■ 4.81
NESP48681 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC45.12■■■■■ 4.81
NESP48681 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC45.12■■■■■ 4.81
NESP48681 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC45.11■■■■■ 4.81
NESP48681 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC45.1■■■■■ 4.81
NESP48681 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC45.1■■■■■ 4.81
NESP48681 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC45.1■■■■■ 4.81
NESP48681 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC45.1■■■■■ 4.81
NESP48681 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC45.09■■■■■ 4.81
NESP48681 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.09■■■■■ 4.81
NESP48681 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC45.09■■■■■ 4.81
NESP48681 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC45.09■■■■■ 4.81
NESP48681 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC45.08■■■■■ 4.81
NESP48681 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC45.08■■■■■ 4.81
NESP48681 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC45.07■■■■■ 4.81
NESP48681 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC45.05■■■■■ 4.8
NESP48681 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC45.05■■■■■ 4.8
NESP48681 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC45.05■■■■■ 4.8
NESP48681 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC45.04■■■■■ 4.8
NESP48681 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC45.04■■■■■ 4.8
NESP48681 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC45.04■■■■■ 4.8
NESP48681 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC45.04■■■■■ 4.8
NESP48681 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC45.03■■■■■ 4.8
NESP48681 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC45.02■■■■■ 4.8
NESP48681 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.02■■■■■ 4.8
NESP48681 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC45.01■■■■■ 4.8
NESP48681 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC45.01■■■■■ 4.8
NESP48681 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC45.01■■■■■ 4.8
NESP48681 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC45.01■■■■■ 4.8
NESP48681 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC45■■■■■ 4.79
NESP48681 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC45■■■■■ 4.79
NESP48681 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC45■■■■■ 4.79
NESP48681 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC44.99■■■■■ 4.79
NESP48681 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC44.99■■■■■ 4.79
NESP48681 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC44.99■■■■■ 4.79
NESP48681 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC44.99■■■■■ 4.79
NESP48681 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC44.99■■■■■ 4.79
NESP48681 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC44.98■■■■■ 4.79
NESP48681 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC44.97■■■■■ 4.79
NESP48681 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC44.97■■■■■ 4.79
NESP48681 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.96■■■■■ 4.79
NESP48681 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.96■■■■■ 4.79
NESP48681 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC44.95■■■■■ 4.79
NESP48681 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC44.94■■■■■ 4.79
NESP48681 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC44.93■■■■■ 4.78
NESP48681 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC44.93■■■■■ 4.78
NESP48681 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC44.93■■■■■ 4.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.7 ms