Protein–RNA interactions for Protein: P48380

RFX3, Transcription factor RFX3, humanhuman

Predictions only

Length 749 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFX3P48380 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
RFX3P48380 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
RFX3P48380 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
RFX3P48380 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
RFX3P48380 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
RFX3P48380 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
RFX3P48380 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
RFX3P48380 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
RFX3P48380 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
RFX3P48380 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
RFX3P48380 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC23.65■■□□□ 1.38
RFX3P48380 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
RFX3P48380 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
RFX3P48380 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
RFX3P48380 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
RFX3P48380 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
RFX3P48380 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
RFX3P48380 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
RFX3P48380 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
RFX3P48380 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
RFX3P48380 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
RFX3P48380 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
RFX3P48380 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
RFX3P48380 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
RFX3P48380 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
RFX3P48380 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
RFX3P48380 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
RFX3P48380 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
RFX3P48380 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
RFX3P48380 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
RFX3P48380 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
RFX3P48380 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RFX3P48380 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RFX3P48380 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
RFX3P48380 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
RFX3P48380 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RFX3P48380 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RFX3P48380 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RFX3P48380 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
RFX3P48380 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
RFX3P48380 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RFX3P48380 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
RFX3P48380 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
RFX3P48380 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
RFX3P48380 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RFX3P48380 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RFX3P48380 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RFX3P48380 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RFX3P48380 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RFX3P48380 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
RFX3P48380 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
RFX3P48380 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
RFX3P48380 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
RFX3P48380 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
RFX3P48380 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
RFX3P48380 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
RFX3P48380 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
RFX3P48380 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
RFX3P48380 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
RFX3P48380 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
RFX3P48380 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
RFX3P48380 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
RFX3P48380 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RFX3P48380 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RFX3P48380 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RFX3P48380 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RFX3P48380 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RFX3P48380 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RFX3P48380 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RFX3P48380 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
RFX3P48380 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RFX3P48380 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RFX3P48380 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
RFX3P48380 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RFX3P48380 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
RFX3P48380 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC23.48■■□□□ 1.35
RFX3P48380 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
RFX3P48380 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RFX3P48380 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
RFX3P48380 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RFX3P48380 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
RFX3P48380 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RFX3P48380 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RFX3P48380 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RFX3P48380 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RFX3P48380 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RFX3P48380 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
RFX3P48380 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RFX3P48380 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RFX3P48380 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
RFX3P48380 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
RFX3P48380 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
RFX3P48380 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RFX3P48380 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RFX3P48380 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RFX3P48380 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RFX3P48380 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RFX3P48380 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
RFX3P48380 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
RFX3P48380 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.2 ms