Protein–RNA interactions for Protein: P42695

NCAPD3, Condensin-2 complex subunit D3, humanhuman

Predictions only

Length 1,498 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCAPD3P42695 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC46.4■■■■■ 5.02
NCAPD3P42695 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC46.4■■■■■ 5.02
NCAPD3P42695 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC46.4■■■■■ 5.02
NCAPD3P42695 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC46.38■■■■■ 5.01
NCAPD3P42695 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.38■■■■■ 5.01
NCAPD3P42695 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.37■■■■■ 5.01
NCAPD3P42695 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.37■■■■■ 5.01
NCAPD3P42695 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC46.37■■■■■ 5.01
NCAPD3P42695 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC46.35■■■■■ 5.01
NCAPD3P42695 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC46.35■■■■■ 5.01
NCAPD3P42695 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC46.34■■■■■ 5.01
NCAPD3P42695 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC46.34■■■■■ 5.01
NCAPD3P42695 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC46.34■■■■■ 5.01
NCAPD3P42695 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.34■■■■■ 5.01
NCAPD3P42695 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC46.34■■■■■ 5.01
NCAPD3P42695 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.33■■■■■ 5.01
NCAPD3P42695 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.33■■■■■ 5.01
NCAPD3P42695 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC46.33■■■■■ 5.01
NCAPD3P42695 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC46.33■■■■■ 5.01
NCAPD3P42695 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC46.32■■■■■ 5.01
NCAPD3P42695 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC46.32■■■■■ 5.01
NCAPD3P42695 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.3■■■■■ 5
NCAPD3P42695 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC46.3■■■■■ 5
NCAPD3P42695 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC46.3■■■■■ 5
NCAPD3P42695 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC46.3■■■■■ 5
NCAPD3P42695 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.29■■■■■ 5
NCAPD3P42695 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC46.27■■■■■ 5
NCAPD3P42695 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC46.26■■■■■ 5
NCAPD3P42695 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC46.25■■■■■ 5
NCAPD3P42695 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC46.25■■■■■ 4.99
NCAPD3P42695 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC46.25■■■■■ 4.99
NCAPD3P42695 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC46.25■■■■■ 4.99
NCAPD3P42695 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC46.25■■■■■ 4.99
NCAPD3P42695 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC46.24■■■■■ 4.99
NCAPD3P42695 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC46.24■■■■■ 4.99
NCAPD3P42695 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC46.22■■■■■ 4.99
NCAPD3P42695 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.22■■■■■ 4.99
NCAPD3P42695 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC46.22■■■■■ 4.99
NCAPD3P42695 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC46.22■■■■■ 4.99
NCAPD3P42695 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC46.21■■■■■ 4.99
NCAPD3P42695 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC46.21■■■■■ 4.99
NCAPD3P42695 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC46.2■■■■■ 4.99
NCAPD3P42695 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.2■■■■■ 4.99
NCAPD3P42695 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC46.2■■■■■ 4.99
NCAPD3P42695 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC46.2■■■■■ 4.99
NCAPD3P42695 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC46.19■■■■■ 4.99
NCAPD3P42695 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC46.19■■■■■ 4.99
NCAPD3P42695 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC46.18■■■■■ 4.98
NCAPD3P42695 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC46.18■■■■■ 4.98
NCAPD3P42695 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC46.18■■■■■ 4.98
NCAPD3P42695 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC46.18■■■■■ 4.98
NCAPD3P42695 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC46.18■■■■■ 4.98
NCAPD3P42695 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC46.18■■■■■ 4.98
NCAPD3P42695 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC46.17■■■■■ 4.98
NCAPD3P42695 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC46.17■■■■■ 4.98
NCAPD3P42695 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC46.17■■■■■ 4.98
NCAPD3P42695 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC46.17■■■■■ 4.98
NCAPD3P42695 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC46.17■■■■■ 4.98
NCAPD3P42695 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC46.15■■■■■ 4.98
NCAPD3P42695 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC46.15■■■■■ 4.98
NCAPD3P42695 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC46.13■■■■■ 4.98
NCAPD3P42695 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC46.13■■■■■ 4.98
NCAPD3P42695 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC46.13■■■■■ 4.98
NCAPD3P42695 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC46.13■■■■■ 4.98
NCAPD3P42695 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC46.12■■■■■ 4.97
NCAPD3P42695 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC46.12■■■■■ 4.97
NCAPD3P42695 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.11■■■■■ 4.97
NCAPD3P42695 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC46.1■■■■■ 4.97
NCAPD3P42695 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.09■■■■■ 4.97
NCAPD3P42695 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC46.08■■■■■ 4.97
NCAPD3P42695 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC46.07■■■■■ 4.97
NCAPD3P42695 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC46.07■■■■■ 4.97
NCAPD3P42695 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC46.07■■■■■ 4.97
NCAPD3P42695 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.07■■■■■ 4.96
NCAPD3P42695 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.06■■■■■ 4.96
NCAPD3P42695 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.05■■■■■ 4.96
NCAPD3P42695 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC46.05■■■■■ 4.96
NCAPD3P42695 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC46.05■■■■■ 4.96
NCAPD3P42695 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.05■■■■■ 4.96
NCAPD3P42695 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.05■■■■■ 4.96
NCAPD3P42695 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC46.05■■■■■ 4.96
NCAPD3P42695 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC46.04■■■■■ 4.96
NCAPD3P42695 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC46.04■■■■■ 4.96
NCAPD3P42695 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC46.03■■■■■ 4.96
NCAPD3P42695 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC46.03■■■■■ 4.96
NCAPD3P42695 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.02■■■■■ 4.96
NCAPD3P42695 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC46.02■■■■■ 4.96
NCAPD3P42695 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC46.02■■■■■ 4.96
NCAPD3P42695 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC46.01■■■■■ 4.96
NCAPD3P42695 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.01■■■■■ 4.96
NCAPD3P42695 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC46.01■■■■■ 4.96
NCAPD3P42695 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46■■■■■ 4.95
NCAPD3P42695 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC46■■■■■ 4.95
NCAPD3P42695 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC45.99■■■■■ 4.95
NCAPD3P42695 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC45.99■■■■■ 4.95
NCAPD3P42695 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC45.99■■■■■ 4.95
NCAPD3P42695 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC45.98■■■■■ 4.95
NCAPD3P42695 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.98■■■■■ 4.95
NCAPD3P42695 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC45.98■■■■■ 4.95
NCAPD3P42695 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC45.97■■■■■ 4.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78.7 ms