Protein–RNA interactions for Protein: P41238

APOBEC1, C->U-editing enzyme APOBEC-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 236 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC1P41238 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
APOBEC1P41238 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
APOBEC1P41238 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
APOBEC1P41238 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
APOBEC1P41238 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
APOBEC1P41238 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
APOBEC1P41238 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
APOBEC1P41238 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
APOBEC1P41238 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
APOBEC1P41238 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
APOBEC1P41238 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
APOBEC1P41238 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
APOBEC1P41238 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
APOBEC1P41238 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
APOBEC1P41238 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
APOBEC1P41238 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
APOBEC1P41238 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
APOBEC1P41238 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
APOBEC1P41238 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
APOBEC1P41238 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
APOBEC1P41238 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
APOBEC1P41238 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
APOBEC1P41238 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
APOBEC1P41238 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
APOBEC1P41238 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
APOBEC1P41238 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
APOBEC1P41238 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
APOBEC1P41238 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
APOBEC1P41238 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
APOBEC1P41238 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
APOBEC1P41238 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
APOBEC1P41238 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
APOBEC1P41238 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
APOBEC1P41238 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
APOBEC1P41238 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
APOBEC1P41238 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
APOBEC1P41238 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
APOBEC1P41238 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
APOBEC1P41238 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
APOBEC1P41238 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
APOBEC1P41238 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
APOBEC1P41238 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
APOBEC1P41238 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
APOBEC1P41238 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
APOBEC1P41238 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
APOBEC1P41238 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
APOBEC1P41238 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
APOBEC1P41238 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
APOBEC1P41238 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
APOBEC1P41238 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
APOBEC1P41238 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
APOBEC1P41238 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
APOBEC1P41238 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
APOBEC1P41238 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
APOBEC1P41238 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
APOBEC1P41238 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
APOBEC1P41238 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
APOBEC1P41238 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC22.91■■□□□ 1.26
APOBEC1P41238 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
APOBEC1P41238 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
APOBEC1P41238 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
APOBEC1P41238 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
APOBEC1P41238 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
APOBEC1P41238 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
APOBEC1P41238 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
APOBEC1P41238 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
APOBEC1P41238 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
APOBEC1P41238 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
APOBEC1P41238 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
APOBEC1P41238 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
APOBEC1P41238 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
APOBEC1P41238 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
APOBEC1P41238 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
APOBEC1P41238 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
APOBEC1P41238 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
APOBEC1P41238 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
APOBEC1P41238 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
APOBEC1P41238 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
APOBEC1P41238 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
APOBEC1P41238 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
APOBEC1P41238 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
APOBEC1P41238 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
APOBEC1P41238 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
APOBEC1P41238 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
APOBEC1P41238 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
APOBEC1P41238 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
APOBEC1P41238 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
APOBEC1P41238 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
APOBEC1P41238 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
APOBEC1P41238 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
APOBEC1P41238 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
APOBEC1P41238 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
APOBEC1P41238 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
APOBEC1P41238 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
APOBEC1P41238 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
APOBEC1P41238 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
APOBEC1P41238 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
APOBEC1P41238 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
APOBEC1P41238 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
APOBEC1P41238 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 121.7 ms