Protein–RNA interactions for Protein: P39958

GDI1, Rab GDP-dissociation inhibitor, yeastyeast

Known RBP Predictions only

Length 451 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
GDI1P39958 TPO1YLL028W 1761 nt7.21□□□□□ -1.25
GDI1P39958 TGA1tA(UGC)A 73 nt7.21□□□□□ -1.26
GDI1P39958 tA(UGC)EtA(UGC)E 73 nt7.21□□□□□ -1.26
GDI1P39958 tA(UGC)GtA(UGC)G 73 nt7.21□□□□□ -1.26
GDI1P39958 tA(UGC)LtA(UGC)L 73 nt7.21□□□□□ -1.26
GDI1P39958 tA(UGC)OtA(UGC)O 73 nt7.21□□□□□ -1.26
GDI1P39958 YGR210CYGR210C 1236 nt7.21□□□□□ -1.26
GDI1P39958 PDC5YLR134W 1692 nt7.21□□□□□ -1.26
GDI1P39958 RRT6YGL146C 936 nt7.2□□□□□ -1.26
GDI1P39958 IDP3YNL009W 1263 nt7.2□□□□□ -1.26
GDI1P39958 FCY1YPR062W 477 nt7.2□□□□□ -1.26
GDI1P39958 ADE5,7YGL234W 2409 nt7.2□□□□□ -1.26
GDI1P39958 ATG22YCL038C 1587 nt7.2□□□□□ -1.26
GDI1P39958 RBS1YDL189W 1374 nt7.2□□□□□ -1.26
GDI1P39958 SMC5YOL034W 3282 nt7.19□□□□□ -1.26
GDI1P39958 ELP6YMR312W 822 nt7.19□□□□□ -1.26
GDI1P39958 SLG1YOR008C 1137 nt7.19□□□□□ -1.26
GDI1P39958 YPL264CYPL264C 1062 nt7.19□□□□□ -1.26
GDI1P39958 PUP3YER094C 618 nt7.18□□□□□ -1.26
GDI1P39958 YMR166CYMR166C 1107 nt7.18□□□□□ -1.26
GDI1P39958 YER152CYER152C 1332 nt7.18□□□□□ -1.26
GDI1P39958 CMK2YOL016C 1344 nt7.18□□□□□ -1.26
GDI1P39958 HXT8YJL214W 1710 nt7.18□□□□□ -1.26
GDI1P39958 OCH1YGL038C 1443 nt7.18□□□□□ -1.26
GDI1P39958 SAM50YNL026W 1455 nt7.17□□□□□ -1.26
GDI1P39958 YCP4YCR004C 744 nt7.17□□□□□ -1.26
GDI1P39958 YGR137WYGR137W 375 nt7.17□□□□□ -1.26
GDI1P39958 RSC9YML127W 1746 nt7.17□□□□□ -1.26
GDI1P39958 TOP3YLR234W 1971 nt7.17□□□□□ -1.26
GDI1P39958 RUP1YOR138C 2016 nt7.17□□□□□ -1.26
GDI1P39958 SHC1YER096W 1539 nt7.17□□□□□ -1.26
GDI1P39958 PEX28YHR150W 1740 nt7.16□□□□□ -1.26
GDI1P39958 LSP1YPL004C 1026 nt7.16□□□□□ -1.26
GDI1P39958 YPL108WYPL108W 507 nt7.16□□□□□ -1.26
GDI1P39958 CIR2YOR356W 1896 nt7.15□□□□□ -1.26
GDI1P39958 CKB1YGL019W 837 nt7.15□□□□□ -1.26
GDI1P39958 RHO1YPR165W 630 nt7.15□□□□□ -1.26
GDI1P39958 CAK1YFL029C 1107 nt7.14□□□□□ -1.27
GDI1P39958 SPE4YLR146C 903 nt7.14□□□□□ -1.27
GDI1P39958 CDA1YLR307W 906 nt7.14□□□□□ -1.27
GDI1P39958 AVL9YLR114C 2295 nt7.13□□□□□ -1.27
GDI1P39958 YEN1YER041W 2280 nt7.12□□□□□ -1.27
GDI1P39958 CHA1YCL064C 1083 nt7.12□□□□□ -1.27
GDI1P39958 YHL030W-AYHL030W-A 462 nt7.12□□□□□ -1.27
GDI1P39958 MTC6YHR151C 1581 nt7.12□□□□□ -1.27
GDI1P39958 SWM1YDR260C 513 nt7.11□□□□□ -1.27
GDI1P39958 YPT31YER031C 672 nt7.11□□□□□ -1.27
GDI1P39958 SNP1YIL061C 903 nt7.11□□□□□ -1.27
GDI1P39958 RRT14YIL127C 621 nt7.11□□□□□ -1.27
GDI1P39958 YMR007WYMR007W 381 nt7.11□□□□□ -1.27
GDI1P39958 EHD3YDR036C 1503 nt7.11□□□□□ -1.27
GDI1P39958 CIT3YPR001W 1461 nt7.11□□□□□ -1.27
GDI1P39958 TES1YJR019C 1050 nt7.1□□□□□ -1.27
GDI1P39958 THI73YLR004C 1572 nt7.1□□□□□ -1.27
GDI1P39958 SNA3YJL151C 402 nt7.09□□□□□ -1.27
GDI1P39958 YLR030WYLR030W 792 nt7.09□□□□□ -1.27
GDI1P39958 RCR1YBR005W 642 nt7.09□□□□□ -1.27
GDI1P39958 ATP10YLR393W 840 nt7.08□□□□□ -1.28
GDI1P39958 GFA1YKL104C 2154 nt7.08□□□□□ -1.28
GDI1P39958 TIM50YPL063W 1431 nt7.07□□□□□ -1.28
GDI1P39958 ERR3YMR323W 1314 nt7.06□□□□□ -1.28
GDI1P39958 ERR1YOR393W 1314 nt7.06□□□□□ -1.28
GDI1P39958 ERR2YPL281C 1314 nt7.06□□□□□ -1.28
GDI1P39958 SHO1YER118C 1104 nt7.05□□□□□ -1.28
GDI1P39958 ERG6YML008C 1152 nt7.05□□□□□ -1.28
GDI1P39958 YPR084WYPR084W 1371 nt7.05□□□□□ -1.28
GDI1P39958 GPA1YHR005C 1419 nt7.04□□□□□ -1.28
GDI1P39958 HEL1YKR017C 1656 nt7.04□□□□□ -1.28
GDI1P39958 PMA2YPL036W 2844 nt7.04□□□□□ -1.28
GDI1P39958 YMR206WYMR206W 942 nt7.04□□□□□ -1.28
GDI1P39958 YMR253CYMR253C 1245 nt7.04□□□□□ -1.28
GDI1P39958 YBR226CYBR226C 411 nt7.04□□□□□ -1.28
GDI1P39958 YBL113CYBL113C 2379 nt7.04□□□□□ -1.28
GDI1P39958 YKR018CYKR018C 2178 nt7.03□□□□□ -1.28
GDI1P39958 GNA1YFL017C 480 nt7.03□□□□□ -1.28
GDI1P39958 YJL160CYJL160C 864 nt7.03□□□□□ -1.28
GDI1P39958 PET18YCR020C 648 nt7.02□□□□□ -1.29
GDI1P39958 YER152W-AYER152W-A 567 nt7.02□□□□□ -1.29
GDI1P39958 VPS65YLR322W 315 nt7.02□□□□□ -1.29
GDI1P39958 RCF2YNR018W 675 nt7.02□□□□□ -1.29
GDI1P39958 PRE10YOR362C 867 nt7.02□□□□□ -1.29
GDI1P39958 AOS1YPR180W 1044 nt7.02□□□□□ -1.29
GDI1P39958 MAL31YBR298C 1845 nt7.01□□□□□ -1.29
GDI1P39958 MAK32YCR019W 1092 nt7.01□□□□□ -1.29
GDI1P39958 YIA6YIL006W 1122 nt7.01□□□□□ -1.29
GDI1P39958 YOR041CYOR041C 432 nt7.01□□□□□ -1.29
GDI1P39958 TCB1YOR086C 3561 nt7.01□□□□□ -1.29
GDI1P39958 BAP3YDR046C 1815 nt7.01□□□□□ -1.29
GDI1P39958 CKI1YLR133W 1749 nt7.01□□□□□ -1.29
GDI1P39958 JHD1YER051W 1479 nt7□□□□□ -1.29
GDI1P39958 FRT1YOR324C 1809 nt7□□□□□ -1.29
GDI1P39958 DST1YGL043W 930 nt7□□□□□ -1.29
GDI1P39958 MFT1YML062C 1179 nt7□□□□□ -1.29
GDI1P39958 RPS6AYPL090C 711 nt7□□□□□ -1.29
GDI1P39958 RPS6BYBR181C 711 nt7□□□□□ -1.29
GDI1P39958 ARG7YMR062C 1326 nt7□□□□□ -1.29
GDI1P39958 SEC24YIL109C 2781 nt6.99□□□□□ -1.29
GDI1P39958 LEO1YOR123C 1395 nt6.99□□□□□ -1.29
GDI1P39958 FAF1YIL019W 1041 nt6.99□□□□□ -1.29
GDI1P39958 HAM1YJR069C 594 nt6.99□□□□□ -1.29
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 11.1 ms