Protein–RNA interactions for Protein: P38316

ATG12, Ubiquitin-like protein ATG12, yeast

Predictions only

Length 186 aa.

Protein		RNA				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	UniProt Accession	Gene	Ensembl Transcript ID	Length	Transcript Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
ATG12	P38316	SPR1	YOR190W	1338 nt		7.86	□□□□□ -1.15
ATG12	P38316	INM1	YHR046C	888 nt		7.85	□□□□□ -1.15
ATG12	P38316	RPR1	RPR1	369 nt		7.85	□□□□□ -1.15
ATG12	P38316	PNS1	YOR161C	1620 nt		7.85	□□□□□ -1.15
ATG12	P38316	TDA4	YJR116W	840 nt		7.84	□□□□□ -1.15
ATG12	P38316	RCF1	YML030W	480 nt		7.84	□□□□□ -1.15
ATG12	P38316	WSC4	YHL028W	1818 nt		7.84	□□□□□ -1.15
ATG12	P38316	FIT1	YDR534C	1587 nt		7.84	□□□□□ -1.15
ATG12	P38316	ARO3	YDR035W	1113 nt		7.83	□□□□□ -1.16
ATG12	P38316	YML079W	YML079W	606 nt		7.83	□□□□□ -1.16
ATG12	P38316	HXT8	YJL214W	1710 nt		7.83	□□□□□ -1.16
ATG12	P38316	YGR137W	YGR137W	375 nt		7.82	□□□□□ -1.16
ATG12	P38316	COS10	YNR075W	1125 nt		7.82	□□□□□ -1.16
ATG12	P38316	GID7	YCL039W	2238 nt		7.82	□□□□□ -1.16
ATG12	P38316	ALG7	YBR243C	1347 nt		7.81	□□□□□ -1.16
ATG12	P38316	MRP7	YNL005C	1116 nt		7.81	□□□□□ -1.16
ATG12	P38316	MDH2	YOL126C	1134 nt		7.8	□□□□□ -1.16
ATG12	P38316	ARG7	YMR062C	1326 nt		7.79	□□□□□ -1.16
ATG12	P38316	UFD1	YGR048W	1086 nt		7.79	□□□□□ -1.16
ATG12	P38316	APT1	YML022W	564 nt		7.79	□□□□□ -1.16
ATG12	P38316	WSC3	YOL105C	1671 nt		7.79	□□□□□ -1.16
ATG12	P38316	YIL177C	YIL177C	5277 nt		7.78	□□□□□ -1.16
ATG12	P38316	PUP2	YGR253C	783 nt		7.78	□□□□□ -1.16
ATG12	P38316	PFS2	YNL317W	1398 nt		7.78	□□□□□ -1.16
ATG12	P38316	ESBP6	YNL125C	2022 nt		7.78	□□□□□ -1.16
ATG12	P38316	HSV2	YGR223C	1347 nt		7.78	□□□□□ -1.16
ATG12	P38316	KTR4	YBR199W	1395 nt		7.77	□□□□□ -1.17
ATG12	P38316	PMT7	YDR307W	1989 nt		7.75	□□□□□ -1.17
ATG12	P38316	ELP6	YMR312W	822 nt		7.75	□□□□□ -1.17
ATG12	P38316	MTC6	YHR151C	1581 nt		7.74	□□□□□ -1.17
ATG12	P38316	MET13	YGL125W	1803 nt		7.73	□□□□□ -1.17
ATG12	P38316	SNP1	YIL061C	903 nt		7.73	□□□□□ -1.17
ATG12	P38316	NCA3	YJL116C	1014 nt		7.73	□□□□□ -1.17
ATG12	P38316	RPL2A	YFR031C-A	765 nt		7.72	□□□□□ -1.17
ATG12	P38316	MNN9	YPL050C	1188 nt		7.72	□□□□□ -1.17
ATG12	P38316	YAL019W-A	YAL019W-A	570 nt		7.71	□□□□□ -1.18
ATG12	P38316	TPO1	YLL028W	1761 nt		7.71	□□□□□ -1.18
ATG12	P38316	LAT1	YNL071W	1449 nt		7.7	□□□□□ -1.18
ATG12	P38316	SLM3	YDL033C	1254 nt		7.7	□□□□□ -1.18
ATG12	P38316	PIH1	YHR034C	1035 nt		7.7	□□□□□ -1.18
ATG12	P38316	URA1	YKL216W	945 nt		7.7	□□□□□ -1.18
ATG12	P38316	PMT1	YDL095W	2454 nt		7.7	□□□□□ -1.18
ATG12	P38316	MAS2	YHR024C	1449 nt		7.69	□□□□□ -1.18
ATG12	P38316	STS1	YIR011C	960 nt		7.69	□□□□□ -1.18
ATG12	P38316	YBL111C	YBL111C	2004 nt		7.69	□□□□□ -1.18
ATG12	P38316	ATP23	YNR020C	813 nt		7.68	□□□□□ -1.18
ATG12	P38316	CRN1	YLR429W	1956 nt		7.68	□□□□□ -1.18
ATG12	P38316	ERV2	YPR037C	591 nt		7.67	□□□□□ -1.18
ATG12	P38316	YOX1	YML027W	1158 nt		7.66	□□□□□ -1.18
ATG12	P38316	AVL9	YLR114C	2295 nt		7.66	□□□□□ -1.18
ATG12	P38316	DOC1	YGL240W	753 nt		7.65	□□□□□ -1.18
ATG12	P38316	TES1	YJR019C	1050 nt		7.65	□□□□□ -1.18
ATG12	P38316	YJR142W	YJR142W	1029 nt		7.65	□□□□□ -1.18
ATG12	P38316	DST1	YGL043W	930 nt		7.64	□□□□□ -1.19
ATG12	P38316	CPR2	YHR057C	618 nt		7.64	□□□□□ -1.19
ATG12	P38316	CDA1	YLR307W	906 nt		7.64	□□□□□ -1.19
ATG12	P38316	MSI1	YBR195C	1269 nt		7.64	□□□□□ -1.19
ATG12	P38316	SGF73	YGL066W	1974 nt		7.64	□□□□□ -1.19
ATG12	P38316	YEL034C-A	YEL034C-A	603 nt		7.63	□□□□□ -1.19
ATG12	P38316	CKB1	YGL019W	837 nt		7.63	□□□□□ -1.19
ATG12	P38316	RRP43	YCR035C	1185 nt		7.62	□□□□□ -1.19
ATG12	P38316	YGL081W	YGL081W	963 nt		7.62	□□□□□ -1.19
ATG12	P38316	AOS1	YPR180W	1044 nt		7.62	□□□□□ -1.19
ATG12	P38316	NMA2	YGR010W	1188 nt		7.61	□□□□□ -1.19
ATG12	P38316	HAM1	YJR069C	594 nt		7.61	□□□□□ -1.19
ATG12	P38316	PTH2	YBL057C	627 nt		7.61	□□□□□ -1.19
ATG12	P38316	STE3	YKL178C	1413 nt		7.61	□□□□□ -1.19
ATG12	P38316	YRF1-1	YDR545W	5391 nt		7.6	□□□□□ -1.19
ATG12	P38316	YRF1-5	YLR467W	5391 nt		7.6	□□□□□ -1.19
ATG12	P38316	YRF1-8	YOR396W	5391 nt		7.6	□□□□□ -1.19
ATG12	P38316	PDC5	YLR134W	1692 nt		7.6	□□□□□ -1.19
ATG12	P38316	YPL264C	YPL264C	1062 nt		7.6	□□□□□ -1.19
ATG12	P38316	PEX28	YHR150W	1740 nt		7.6	□□□□□ -1.19
ATG12	P38316	CKI1	YLR133W	1749 nt		7.6	□□□□□ -1.19
ATG12	P38316	RSC9	YML127W	1746 nt		7.6	□□□□□ -1.19
ATG12	P38316	PSA1	YDL055C	1086 nt		7.59	□□□□□ -1.19
ATG12	P38316	INP54	YOL065C	1155 nt		7.59	□□□□□ -1.19
ATG12	P38316	OSM1	YJR051W	1506 nt		7.58	□□□□□ -1.2
ATG12	P38316	SNA3	YJL151C	402 nt		7.58	□□□□□ -1.2
ATG12	P38316	YNL295W	YNL295W	1575 nt		7.58	□□□□□ -1.2
ATG12	P38316	YML034C-A	YML034C-A	399 nt		7.57	□□□□□ -1.2
ATG12	P38316	CDC3	YLR314C	1563 nt		7.57	□□□□□ -1.2
ATG12	P38316	HRB1	YNL004W	1365 nt		7.57	□□□□□ -1.2
ATG12	P38316	HXT9	YJL219W	1704 nt		7.55	□□□□□ -1.2
ATG12	P38316	YPQ1	YOL092W	927 nt		7.55	□□□□□ -1.2
ATG12	P38316	UME1	YPL139C	1383 nt		7.55	□□□□□ -1.2
ATG12	P38316	LPD1	YFL018C	1500 nt		7.54	□□□□□ -1.2
ATG12	P38316	TRR2	YHR106W	1029 nt		7.54	□□□□□ -1.2
ATG12	P38316	AIM46	YHR199C	933 nt		7.54	□□□□□ -1.2
ATG12	P38316	YJL144W	YJL144W	315 nt		7.54	□□□□□ -1.2
ATG12	P38316	RCF2	YNR018W	675 nt		7.54	□□□□□ -1.2
ATG12	P38316	YPT10	YBR264C	600 nt		7.54	□□□□□ -1.2
ATG12	P38316	RUP1	YOR138C	2016 nt		7.54	□□□□□ -1.2
ATG12	P38316	YER152C	YER152C	1332 nt		7.53	□□□□□ -1.2
ATG12	P38316	VPS65	YLR322W	315 nt		7.53	□□□□□ -1.2
ATG12	P38316	ERV25	YML012W	636 nt		7.53	□□□□□ -1.2
ATG12	P38316	AIM34	YMR003W	597 nt		7.53	□□□□□ -1.2
ATG12	P38316	YPL067C	YPL067C	597 nt		7.53	□□□□□ -1.2
ATG12	P38316	LEO1	YOR123C	1395 nt		7.53	□□□□□ -1.2
ATG12	P38316	PRC1	YMR297W	1599 nt		7.52	□□□□□ -1.21

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