Protein–RNA interactions for Protein: P28328

PEX2, Peroxisome biogenesis factor 2, humanhuman

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PEX2P28328 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PEX2P28328 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PEX2P28328 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PEX2P28328 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PEX2P28328 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PEX2P28328 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PEX2P28328 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
PEX2P28328 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PEX2P28328 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PEX2P28328 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PEX2P28328 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PEX2P28328 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
PEX2P28328 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PEX2P28328 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PEX2P28328 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PEX2P28328 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PEX2P28328 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PEX2P28328 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PEX2P28328 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PEX2P28328 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PEX2P28328 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PEX2P28328 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PEX2P28328 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
PEX2P28328 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
PEX2P28328 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
PEX2P28328 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
PEX2P28328 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PEX2P28328 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PEX2P28328 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PEX2P28328 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PEX2P28328 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PEX2P28328 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
PEX2P28328 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PEX2P28328 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
PEX2P28328 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
PEX2P28328 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
PEX2P28328 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PEX2P28328 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PEX2P28328 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PEX2P28328 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PEX2P28328 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
PEX2P28328 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
PEX2P28328 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
PEX2P28328 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PEX2P28328 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PEX2P28328 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PEX2P28328 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PEX2P28328 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PEX2P28328 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
PEX2P28328 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
PEX2P28328 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PEX2P28328 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PEX2P28328 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PEX2P28328 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
PEX2P28328 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PEX2P28328 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PEX2P28328 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PEX2P28328 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PEX2P28328 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PEX2P28328 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC23.79■■□□□ 1.4
PEX2P28328 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
PEX2P28328 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
PEX2P28328 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PEX2P28328 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PEX2P28328 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PEX2P28328 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PEX2P28328 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
PEX2P28328 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
PEX2P28328 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
PEX2P28328 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PEX2P28328 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PEX2P28328 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PEX2P28328 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
PEX2P28328 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PEX2P28328 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PEX2P28328 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PEX2P28328 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PEX2P28328 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PEX2P28328 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PEX2P28328 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PEX2P28328 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PEX2P28328 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PEX2P28328 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PEX2P28328 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PEX2P28328 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PEX2P28328 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PEX2P28328 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PEX2P28328 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PEX2P28328 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PEX2P28328 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PEX2P28328 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PEX2P28328 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PEX2P28328 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PEX2P28328 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PEX2P28328 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PEX2P28328 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PEX2P28328 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PEX2P28328 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
PEX2P28328 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
PEX2P28328 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.2 ms