Protein–RNA interactions for Protein: P22674

CCNO, Cyclin-O, humanhuman

Predictions only

Length 350 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNOP22674 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
CCNOP22674 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCNOP22674 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCNOP22674 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCNOP22674 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCNOP22674 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCNOP22674 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCNOP22674 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
CCNOP22674 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCNOP22674 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCNOP22674 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCNOP22674 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCNOP22674 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCNOP22674 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CCNOP22674 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCNOP22674 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCNOP22674 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCNOP22674 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCNOP22674 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCNOP22674 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCNOP22674 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCNOP22674 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCNOP22674 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCNOP22674 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCNOP22674 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCNOP22674 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCNOP22674 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCNOP22674 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCNOP22674 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCNOP22674 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
CCNOP22674 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
CCNOP22674 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
CCNOP22674 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCNOP22674 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
CCNOP22674 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCNOP22674 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCNOP22674 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCNOP22674 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCNOP22674 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCNOP22674 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCNOP22674 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCNOP22674 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCNOP22674 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCNOP22674 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCNOP22674 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCNOP22674 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCNOP22674 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCNOP22674 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
CCNOP22674 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCNOP22674 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CCNOP22674 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCNOP22674 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCNOP22674 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCNOP22674 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCNOP22674 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCNOP22674 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCNOP22674 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCNOP22674 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCNOP22674 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCNOP22674 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCNOP22674 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCNOP22674 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCNOP22674 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCNOP22674 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCNOP22674 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCNOP22674 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCNOP22674 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCNOP22674 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
CCNOP22674 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCNOP22674 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCNOP22674 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCNOP22674 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCNOP22674 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCNOP22674 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
CCNOP22674 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
CCNOP22674 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
CCNOP22674 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
CCNOP22674 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
CCNOP22674 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
CCNOP22674 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
CCNOP22674 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
CCNOP22674 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
CCNOP22674 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCNOP22674 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCNOP22674 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCNOP22674 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCNOP22674 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCNOP22674 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCNOP22674 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCNOP22674 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCNOP22674 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCNOP22674 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCNOP22674 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCNOP22674 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
CCNOP22674 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCNOP22674 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCNOP22674 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCNOP22674 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCNOP22674 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCNOP22674 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 94.9 ms