Protein–RNA interactions for Protein: P20396

TRH, Pro-thyrotropin-releasing hormone, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRHP20396 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC41■■■■■ 4.15
TRHP20396 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC40.98■■■■■ 4.15
TRHP20396 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC40.97■■■■■ 4.15
TRHP20396 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC40.97■■■■■ 4.15
TRHP20396 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.96■■■■■ 4.15
TRHP20396 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC40.95■■■■■ 4.15
TRHP20396 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC40.95■■■■■ 4.15
TRHP20396 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC40.93■■■■■ 4.14
TRHP20396 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC40.93■■■■■ 4.14
TRHP20396 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.92■■■■■ 4.14
TRHP20396 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC40.92■■■■■ 4.14
TRHP20396 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC40.91■■■■■ 4.14
TRHP20396 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC40.9■■■■■ 4.14
TRHP20396 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC40.9■■■■■ 4.14
TRHP20396 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC40.89■■■■■ 4.14
TRHP20396 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC40.89■■■■■ 4.14
TRHP20396 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC40.89■■■■■ 4.14
TRHP20396 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC40.88■■■■■ 4.13
TRHP20396 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC40.87■■■■■ 4.13
TRHP20396 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC40.87■■■■■ 4.13
TRHP20396 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC40.86■■■■■ 4.13
TRHP20396 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC40.86■■■■■ 4.13
TRHP20396 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC40.85■■■■■ 4.13
TRHP20396 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC40.85■■■■■ 4.13
TRHP20396 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC40.85■■■■■ 4.13
TRHP20396 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.84■■■■■ 4.13
TRHP20396 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC40.84■■■■■ 4.13
TRHP20396 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC40.84■■■■■ 4.13
TRHP20396 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC40.83■■■■■ 4.13
TRHP20396 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC40.83■■■■■ 4.13
TRHP20396 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC40.83■■■■■ 4.13
TRHP20396 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC40.83■■■■■ 4.13
TRHP20396 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.83■■■■■ 4.13
TRHP20396 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC40.83■■■■■ 4.13
TRHP20396 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC40.82■■■■■ 4.13
TRHP20396 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.82■■■■■ 4.13
TRHP20396 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC40.82■■■■■ 4.12
TRHP20396 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC40.81■■■■■ 4.12
TRHP20396 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40.79■■■■■ 4.12
TRHP20396 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC40.79■■■■■ 4.12
TRHP20396 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC40.78■■■■■ 4.12
TRHP20396 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC40.78■■■■■ 4.12
TRHP20396 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.77■■■■■ 4.12
TRHP20396 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40.77■■■■■ 4.12
TRHP20396 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC40.76■■■■■ 4.12
TRHP20396 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC40.76■■■■■ 4.11
TRHP20396 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40.75■■■■■ 4.11
TRHP20396 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC40.74■■■■■ 4.11
TRHP20396 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC40.73■■■■■ 4.11
TRHP20396 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC40.73■■■■■ 4.11
TRHP20396 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC40.73■■■■■ 4.11
TRHP20396 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC40.72■■■■■ 4.11
TRHP20396 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC40.72■■■■■ 4.11
TRHP20396 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC40.72■■■■■ 4.11
TRHP20396 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.71■■■■■ 4.11
TRHP20396 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.71■■■■■ 4.11
TRHP20396 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC40.7■■■■■ 4.11
TRHP20396 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC40.7■■■■■ 4.11
TRHP20396 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.69■■■■■ 4.11
TRHP20396 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.69■■■■■ 4.1
TRHP20396 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC40.69■■■■■ 4.1
TRHP20396 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC40.67■■■■■ 4.1
TRHP20396 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC40.67■■■■■ 4.1
TRHP20396 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC40.67■■■■■ 4.1
TRHP20396 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.67■■■■■ 4.1
TRHP20396 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.66■■■■■ 4.1
TRHP20396 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC40.66■■■■■ 4.1
TRHP20396 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC40.66■■■■■ 4.1
TRHP20396 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.65■■■■■ 4.1
TRHP20396 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC40.65■■■■■ 4.1
TRHP20396 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40.64■■■■■ 4.1
TRHP20396 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC40.64■■■■■ 4.1
TRHP20396 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC40.63■■■■■ 4.09
TRHP20396 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC40.63■■■■■ 4.09
TRHP20396 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC40.63■■■■■ 4.09
TRHP20396 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40.62■■■■■ 4.09
TRHP20396 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC40.62■■■■■ 4.09
TRHP20396 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC40.62■■■■■ 4.09
TRHP20396 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40.61■■■■■ 4.09
TRHP20396 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC40.61■■■■■ 4.09
TRHP20396 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC40.61■■■■■ 4.09
TRHP20396 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC40.61■■■■■ 4.09
TRHP20396 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC40.6■■■■■ 4.09
TRHP20396 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC40.6■■■■■ 4.09
TRHP20396 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC40.6■■■■■ 4.09
TRHP20396 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC40.6■■■■■ 4.09
TRHP20396 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC40.6■■■■■ 4.09
TRHP20396 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC40.59■■■■■ 4.09
TRHP20396 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC40.59■■■■■ 4.09
TRHP20396 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC40.59■■■■■ 4.09
TRHP20396 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC40.59■■■■■ 4.09
TRHP20396 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC40.59■■■■■ 4.09
TRHP20396 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC40.58■■■■■ 4.09
TRHP20396 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC40.58■■■■■ 4.09
TRHP20396 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC40.57■■■■■ 4.09
TRHP20396 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.57■■■■■ 4.08
TRHP20396 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.56■■■■■ 4.08
TRHP20396 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC40.56■■■■■ 4.08
TRHP20396 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.56■■■■■ 4.08
TRHP20396 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC40.55■■■■■ 4.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.3 ms