Protein–RNA interactions for Protein: P15884

TCF4, Transcription factor 4, humanhuman

Predictions only

Length 667 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCF4P15884 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.84
TCF4P15884 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC26.57■■□□□ 1.84
TCF4P15884 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
TCF4P15884 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
TCF4P15884 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
TCF4P15884 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
TCF4P15884 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC26.57■■□□□ 1.84
TCF4P15884 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
TCF4P15884 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
TCF4P15884 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
TCF4P15884 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
TCF4P15884 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
TCF4P15884 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
TCF4P15884 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
TCF4P15884 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
TCF4P15884 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
TCF4P15884 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
TCF4P15884 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC26.53■■□□□ 1.84
TCF4P15884 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
TCF4P15884 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
TCF4P15884 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
TCF4P15884 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
TCF4P15884 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
TCF4P15884 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
TCF4P15884 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC26.51■■□□□ 1.84
TCF4P15884 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
TCF4P15884 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
TCF4P15884 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
TCF4P15884 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
TCF4P15884 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
TCF4P15884 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC26.5■■□□□ 1.83
TCF4P15884 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
TCF4P15884 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
TCF4P15884 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
TCF4P15884 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
TCF4P15884 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
TCF4P15884 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
TCF4P15884 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
TCF4P15884 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
TCF4P15884 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
TCF4P15884 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
TCF4P15884 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
TCF4P15884 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
TCF4P15884 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
TCF4P15884 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
TCF4P15884 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
TCF4P15884 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC26.47■■□□□ 1.83
TCF4P15884 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
TCF4P15884 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
TCF4P15884 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
TCF4P15884 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.83
TCF4P15884 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
TCF4P15884 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
TCF4P15884 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
TCF4P15884 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
TCF4P15884 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
TCF4P15884 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
TCF4P15884 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
TCF4P15884 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
TCF4P15884 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
TCF4P15884 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC26.43■■□□□ 1.82
TCF4P15884 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
TCF4P15884 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
TCF4P15884 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
TCF4P15884 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
TCF4P15884 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
TCF4P15884 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
TCF4P15884 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
TCF4P15884 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
TCF4P15884 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
TCF4P15884 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
TCF4P15884 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
TCF4P15884 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
TCF4P15884 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
TCF4P15884 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
TCF4P15884 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC26.4■■□□□ 1.82
TCF4P15884 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
TCF4P15884 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
TCF4P15884 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
TCF4P15884 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
TCF4P15884 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
TCF4P15884 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
TCF4P15884 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.81
TCF4P15884 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
TCF4P15884 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
TCF4P15884 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
TCF4P15884 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
TCF4P15884 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC26.36■■□□□ 1.81
TCF4P15884 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC26.36■■□□□ 1.81
TCF4P15884 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
TCF4P15884 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.36■■□□□ 1.81
TCF4P15884 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
TCF4P15884 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
TCF4P15884 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
TCF4P15884 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
TCF4P15884 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
TCF4P15884 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
TCF4P15884 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
TCF4P15884 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
TCF4P15884 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 95.6 ms