Protein–RNA interactions for Protein: P12270

TPR, Nucleoprotein TPR, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,363 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPRP12270 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TPRP12270 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
TPRP12270 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
TPRP12270 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
TPRP12270 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
TPRP12270 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
TPRP12270 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC24.45■■□□□ 1.51
TPRP12270 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TPRP12270 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TPRP12270 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TPRP12270 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TPRP12270 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TPRP12270 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TPRP12270 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TPRP12270 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TPRP12270 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TPRP12270 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TPRP12270 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TPRP12270 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TPRP12270 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TPRP12270 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
TPRP12270 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TPRP12270 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
TPRP12270 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
TPRP12270 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TPRP12270 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
TPRP12270 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
TPRP12270 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
TPRP12270 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
TPRP12270 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC24.4■■□□□ 1.5
TPRP12270 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC24.39■■□□□ 1.5
TPRP12270 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC24.39■■□□□ 1.5
TPRP12270 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
TPRP12270 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
TPRP12270 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
TPRP12270 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
TPRP12270 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TPRP12270 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TPRP12270 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TPRP12270 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TPRP12270 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
TPRP12270 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TPRP12270 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
TPRP12270 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TPRP12270 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TPRP12270 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TPRP12270 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TPRP12270 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TPRP12270 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TPRP12270 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TPRP12270 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TPRP12270 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TPRP12270 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TPRP12270 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TPRP12270 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TPRP12270 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TPRP12270 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
TPRP12270 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TPRP12270 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
TPRP12270 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TPRP12270 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TPRP12270 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TPRP12270 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
TPRP12270 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TPRP12270 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TPRP12270 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TPRP12270 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TPRP12270 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TPRP12270 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TPRP12270 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TPRP12270 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TPRP12270 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TPRP12270 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TPRP12270 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TPRP12270 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TPRP12270 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TPRP12270 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TPRP12270 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TPRP12270 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TPRP12270 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TPRP12270 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TPRP12270 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TPRP12270 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
TPRP12270 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TPRP12270 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TPRP12270 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TPRP12270 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TPRP12270 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TPRP12270 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TPRP12270 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TPRP12270 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
TPRP12270 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TPRP12270 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
TPRP12270 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TPRP12270 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TPRP12270 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
TPRP12270 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
TPRP12270 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TPRP12270 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
TPRP12270 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.1 ms