Protein–RNA interactions for Protein: P10745

RBP3, Retinol-binding protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBP3P10745 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
RBP3P10745 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
RBP3P10745 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
RBP3P10745 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
RBP3P10745 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC26.16■■□□□ 1.78
RBP3P10745 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
RBP3P10745 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
RBP3P10745 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
RBP3P10745 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
RBP3P10745 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
RBP3P10745 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.78
RBP3P10745 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
RBP3P10745 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
RBP3P10745 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
RBP3P10745 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
RBP3P10745 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
RBP3P10745 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
RBP3P10745 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
RBP3P10745 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
RBP3P10745 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
RBP3P10745 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
RBP3P10745 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
RBP3P10745 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
RBP3P10745 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
RBP3P10745 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
RBP3P10745 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC26.1■■□□□ 1.77
RBP3P10745 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
RBP3P10745 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
RBP3P10745 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
RBP3P10745 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC26.09■■□□□ 1.77
RBP3P10745 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC26.09■■□□□ 1.77
RBP3P10745 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
RBP3P10745 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
RBP3P10745 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
RBP3P10745 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
RBP3P10745 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
RBP3P10745 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
RBP3P10745 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
RBP3P10745 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
RBP3P10745 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
RBP3P10745 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
RBP3P10745 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
RBP3P10745 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
RBP3P10745 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
RBP3P10745 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
RBP3P10745 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
RBP3P10745 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
RBP3P10745 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
RBP3P10745 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC26.05■■□□□ 1.76
RBP3P10745 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
RBP3P10745 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
RBP3P10745 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
RBP3P10745 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
RBP3P10745 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
RBP3P10745 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
RBP3P10745 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
RBP3P10745 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
RBP3P10745 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
RBP3P10745 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
RBP3P10745 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
RBP3P10745 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
RBP3P10745 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
RBP3P10745 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
RBP3P10745 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
RBP3P10745 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC26.02■■□□□ 1.76
RBP3P10745 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
RBP3P10745 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
RBP3P10745 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
RBP3P10745 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC26.01■■□□□ 1.75
RBP3P10745 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
RBP3P10745 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
RBP3P10745 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
RBP3P10745 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
RBP3P10745 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC26■■□□□ 1.75
RBP3P10745 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC26■■□□□ 1.75
RBP3P10745 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
RBP3P10745 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
RBP3P10745 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
RBP3P10745 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
RBP3P10745 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
RBP3P10745 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
RBP3P10745 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
RBP3P10745 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
RBP3P10745 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
RBP3P10745 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
RBP3P10745 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
RBP3P10745 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
RBP3P10745 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
RBP3P10745 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
RBP3P10745 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
RBP3P10745 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
RBP3P10745 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
RBP3P10745 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
RBP3P10745 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
RBP3P10745 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
RBP3P10745 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
RBP3P10745 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
RBP3P10745 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
RBP3P10745 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
RBP3P10745 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.4 ms