Protein–RNA interactions for Protein: P0DP42

TMEM225B, Transmembrane protein 225B, humanhuman

Predictions only

Length 221 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM225BP0DP42 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TMEM225BP0DP42 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
TMEM225BP0DP42 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TMEM225BP0DP42 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TMEM225BP0DP42 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TMEM225BP0DP42 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TMEM225BP0DP42 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TMEM225BP0DP42 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TMEM225BP0DP42 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TMEM225BP0DP42 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
TMEM225BP0DP42 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
TMEM225BP0DP42 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
TMEM225BP0DP42 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TMEM225BP0DP42 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TMEM225BP0DP42 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TMEM225BP0DP42 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
TMEM225BP0DP42 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TMEM225BP0DP42 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TMEM225BP0DP42 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
TMEM225BP0DP42 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
TMEM225BP0DP42 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
TMEM225BP0DP42 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
TMEM225BP0DP42 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TMEM225BP0DP42 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
TMEM225BP0DP42 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
TMEM225BP0DP42 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
TMEM225BP0DP42 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TMEM225BP0DP42 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TMEM225BP0DP42 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TMEM225BP0DP42 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
TMEM225BP0DP42 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TMEM225BP0DP42 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TMEM225BP0DP42 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
TMEM225BP0DP42 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
TMEM225BP0DP42 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
TMEM225BP0DP42 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TMEM225BP0DP42 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TMEM225BP0DP42 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
TMEM225BP0DP42 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TMEM225BP0DP42 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
TMEM225BP0DP42 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
TMEM225BP0DP42 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TMEM225BP0DP42 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TMEM225BP0DP42 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TMEM225BP0DP42 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
TMEM225BP0DP42 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
TMEM225BP0DP42 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TMEM225BP0DP42 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
TMEM225BP0DP42 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
TMEM225BP0DP42 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
TMEM225BP0DP42 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TMEM225BP0DP42 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
TMEM225BP0DP42 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
TMEM225BP0DP42 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
TMEM225BP0DP42 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
TMEM225BP0DP42 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
TMEM225BP0DP42 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
TMEM225BP0DP42 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TMEM225BP0DP42 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TMEM225BP0DP42 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TMEM225BP0DP42 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TMEM225BP0DP42 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TMEM225BP0DP42 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TMEM225BP0DP42 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
TMEM225BP0DP42 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TMEM225BP0DP42 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TMEM225BP0DP42 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TMEM225BP0DP42 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TMEM225BP0DP42 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
TMEM225BP0DP42 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TMEM225BP0DP42 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TMEM225BP0DP42 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TMEM225BP0DP42 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
TMEM225BP0DP42 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
TMEM225BP0DP42 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC21.58■■□□□ 1.05
TMEM225BP0DP42 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
TMEM225BP0DP42 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
TMEM225BP0DP42 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
TMEM225BP0DP42 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
TMEM225BP0DP42 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TMEM225BP0DP42 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TMEM225BP0DP42 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TMEM225BP0DP42 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TMEM225BP0DP42 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TMEM225BP0DP42 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TMEM225BP0DP42 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TMEM225BP0DP42 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TMEM225BP0DP42 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TMEM225BP0DP42 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TMEM225BP0DP42 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TMEM225BP0DP42 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TMEM225BP0DP42 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TMEM225BP0DP42 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TMEM225BP0DP42 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
TMEM225BP0DP42 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TMEM225BP0DP42 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TMEM225BP0DP42 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TMEM225BP0DP42 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TMEM225BP0DP42 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TMEM225BP0DP42 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms