Protein–RNA interactions for Protein: P0CG47

UBB, Polyubiquitin-B, humanhuman

Predictions only

Length 229 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBBP0CG47 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
UBBP0CG47 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
UBBP0CG47 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
UBBP0CG47 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
UBBP0CG47 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
UBBP0CG47 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
UBBP0CG47 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
UBBP0CG47 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
UBBP0CG47 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
UBBP0CG47 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
UBBP0CG47 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
UBBP0CG47 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
UBBP0CG47 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
UBBP0CG47 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
UBBP0CG47 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
UBBP0CG47 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
UBBP0CG47 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
UBBP0CG47 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
UBBP0CG47 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
UBBP0CG47 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
UBBP0CG47 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
UBBP0CG47 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
UBBP0CG47 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
UBBP0CG47 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
UBBP0CG47 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
UBBP0CG47 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
UBBP0CG47 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
UBBP0CG47 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
UBBP0CG47 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
UBBP0CG47 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
UBBP0CG47 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
UBBP0CG47 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
UBBP0CG47 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
UBBP0CG47 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
UBBP0CG47 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
UBBP0CG47 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
UBBP0CG47 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
UBBP0CG47 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
UBBP0CG47 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
UBBP0CG47 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
UBBP0CG47 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
UBBP0CG47 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
UBBP0CG47 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
UBBP0CG47 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
UBBP0CG47 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
UBBP0CG47 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
UBBP0CG47 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
UBBP0CG47 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
UBBP0CG47 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
UBBP0CG47 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
UBBP0CG47 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
UBBP0CG47 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
UBBP0CG47 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
UBBP0CG47 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
UBBP0CG47 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
UBBP0CG47 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
UBBP0CG47 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
UBBP0CG47 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
UBBP0CG47 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
UBBP0CG47 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
UBBP0CG47 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
UBBP0CG47 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
UBBP0CG47 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
UBBP0CG47 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
UBBP0CG47 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
UBBP0CG47 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
UBBP0CG47 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
UBBP0CG47 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
UBBP0CG47 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
UBBP0CG47 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
UBBP0CG47 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
UBBP0CG47 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
UBBP0CG47 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
UBBP0CG47 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
UBBP0CG47 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
UBBP0CG47 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
UBBP0CG47 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
UBBP0CG47 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
UBBP0CG47 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
UBBP0CG47 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
UBBP0CG47 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
UBBP0CG47 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
UBBP0CG47 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
UBBP0CG47 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
UBBP0CG47 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
UBBP0CG47 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
UBBP0CG47 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
UBBP0CG47 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
UBBP0CG47 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
UBBP0CG47 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
UBBP0CG47 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
UBBP0CG47 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
UBBP0CG47 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
UBBP0CG47 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
UBBP0CG47 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
UBBP0CG47 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
UBBP0CG47 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
UBBP0CG47 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
UBBP0CG47 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
UBBP0CG47 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.4 ms