Protein–RNA interactions for Protein: P0C7W6

CCDC172, Coiled-coil domain-containing protein 172, humanhuman

Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC172P0C7W6 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
CCDC172P0C7W6 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
CCDC172P0C7W6 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
CCDC172P0C7W6 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
CCDC172P0C7W6 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC27.3■■□□□ 1.96
CCDC172P0C7W6 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
CCDC172P0C7W6 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
CCDC172P0C7W6 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
CCDC172P0C7W6 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
CCDC172P0C7W6 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
CCDC172P0C7W6 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
CCDC172P0C7W6 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
CCDC172P0C7W6 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
CCDC172P0C7W6 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
CCDC172P0C7W6 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
CCDC172P0C7W6 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
CCDC172P0C7W6 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
CCDC172P0C7W6 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
CCDC172P0C7W6 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
CCDC172P0C7W6 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
CCDC172P0C7W6 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
CCDC172P0C7W6 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
CCDC172P0C7W6 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC27.24■■□□□ 1.95
CCDC172P0C7W6 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
CCDC172P0C7W6 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
CCDC172P0C7W6 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC27.23■■□□□ 1.95
CCDC172P0C7W6 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CCDC172P0C7W6 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CCDC172P0C7W6 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CCDC172P0C7W6 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CCDC172P0C7W6 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
CCDC172P0C7W6 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC27.21■■□□□ 1.95
CCDC172P0C7W6 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CCDC172P0C7W6 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
CCDC172P0C7W6 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
CCDC172P0C7W6 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.95
CCDC172P0C7W6 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
CCDC172P0C7W6 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
CCDC172P0C7W6 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
CCDC172P0C7W6 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CCDC172P0C7W6 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
CCDC172P0C7W6 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
CCDC172P0C7W6 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
CCDC172P0C7W6 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
CCDC172P0C7W6 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CCDC172P0C7W6 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CCDC172P0C7W6 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
CCDC172P0C7W6 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC27.16■■□□□ 1.94
CCDC172P0C7W6 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
CCDC172P0C7W6 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CCDC172P0C7W6 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CCDC172P0C7W6 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
CCDC172P0C7W6 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC27.15■■□□□ 1.94
CCDC172P0C7W6 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CCDC172P0C7W6 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
CCDC172P0C7W6 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
CCDC172P0C7W6 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC27.14■■□□□ 1.94
CCDC172P0C7W6 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
CCDC172P0C7W6 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
CCDC172P0C7W6 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
CCDC172P0C7W6 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CCDC172P0C7W6 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
CCDC172P0C7W6 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
CCDC172P0C7W6 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
CCDC172P0C7W6 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CCDC172P0C7W6 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CCDC172P0C7W6 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CCDC172P0C7W6 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
CCDC172P0C7W6 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
CCDC172P0C7W6 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC27.11■■□□□ 1.93
CCDC172P0C7W6 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC27.11■■□□□ 1.93
CCDC172P0C7W6 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CCDC172P0C7W6 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
CCDC172P0C7W6 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
CCDC172P0C7W6 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CCDC172P0C7W6 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CCDC172P0C7W6 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CCDC172P0C7W6 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
CCDC172P0C7W6 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CCDC172P0C7W6 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CCDC172P0C7W6 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CCDC172P0C7W6 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CCDC172P0C7W6 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CCDC172P0C7W6 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
CCDC172P0C7W6 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CCDC172P0C7W6 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CCDC172P0C7W6 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
CCDC172P0C7W6 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CCDC172P0C7W6 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CCDC172P0C7W6 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CCDC172P0C7W6 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CCDC172P0C7W6 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CCDC172P0C7W6 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CCDC172P0C7W6 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
CCDC172P0C7W6 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CCDC172P0C7W6 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC27.04■■□□□ 1.92
CCDC172P0C7W6 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CCDC172P0C7W6 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC27.04■■□□□ 1.92
CCDC172P0C7W6 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
CCDC172P0C7W6 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.6 ms