Protein–RNA interactions for Protein: P09603

CSF1, Macrophage colony-stimulating factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 554 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSF1P09603 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CSF1P09603 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CSF1P09603 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CSF1P09603 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CSF1P09603 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CSF1P09603 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CSF1P09603 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CSF1P09603 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CSF1P09603 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CSF1P09603 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
CSF1P09603 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CSF1P09603 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CSF1P09603 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CSF1P09603 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CSF1P09603 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CSF1P09603 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CSF1P09603 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CSF1P09603 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CSF1P09603 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CSF1P09603 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CSF1P09603 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CSF1P09603 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
CSF1P09603 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CSF1P09603 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CSF1P09603 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CSF1P09603 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CSF1P09603 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CSF1P09603 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CSF1P09603 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CSF1P09603 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CSF1P09603 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CSF1P09603 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CSF1P09603 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CSF1P09603 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CSF1P09603 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CSF1P09603 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CSF1P09603 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CSF1P09603 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CSF1P09603 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CSF1P09603 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CSF1P09603 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CSF1P09603 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CSF1P09603 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CSF1P09603 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CSF1P09603 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CSF1P09603 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
CSF1P09603 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CSF1P09603 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CSF1P09603 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
CSF1P09603 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CSF1P09603 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CSF1P09603 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CSF1P09603 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CSF1P09603 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CSF1P09603 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CSF1P09603 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CSF1P09603 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
CSF1P09603 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CSF1P09603 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
CSF1P09603 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
CSF1P09603 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CSF1P09603 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CSF1P09603 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CSF1P09603 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CSF1P09603 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CSF1P09603 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CSF1P09603 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CSF1P09603 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CSF1P09603 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CSF1P09603 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CSF1P09603 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CSF1P09603 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CSF1P09603 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CSF1P09603 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CSF1P09603 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CSF1P09603 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CSF1P09603 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CSF1P09603 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CSF1P09603 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CSF1P09603 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CSF1P09603 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CSF1P09603 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CSF1P09603 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CSF1P09603 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CSF1P09603 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CSF1P09603 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CSF1P09603 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CSF1P09603 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CSF1P09603 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CSF1P09603 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CSF1P09603 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CSF1P09603 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CSF1P09603 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CSF1P09603 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CSF1P09603 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CSF1P09603 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CSF1P09603 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CSF1P09603 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CSF1P09603 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CSF1P09603 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 1015.3 ms