Protein–RNA interactions for Protein: P08779

KRT16, Keratin, type I cytoskeletal 16, humanhuman

Predictions only

Length 473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT16P08779 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
KRT16P08779 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
KRT16P08779 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
KRT16P08779 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
KRT16P08779 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
KRT16P08779 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
KRT16P08779 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
KRT16P08779 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
KRT16P08779 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
KRT16P08779 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
KRT16P08779 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
KRT16P08779 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
KRT16P08779 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
KRT16P08779 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
KRT16P08779 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
KRT16P08779 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
KRT16P08779 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC24.9■■□□□ 1.58
KRT16P08779 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
KRT16P08779 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
KRT16P08779 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
KRT16P08779 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
KRT16P08779 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
KRT16P08779 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
KRT16P08779 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
KRT16P08779 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
KRT16P08779 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
KRT16P08779 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC24.89■■□□□ 1.57
KRT16P08779 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
KRT16P08779 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
KRT16P08779 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
KRT16P08779 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
KRT16P08779 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
KRT16P08779 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
KRT16P08779 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
KRT16P08779 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
KRT16P08779 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
KRT16P08779 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
KRT16P08779 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
KRT16P08779 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
KRT16P08779 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
KRT16P08779 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
KRT16P08779 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
KRT16P08779 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
KRT16P08779 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
KRT16P08779 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
KRT16P08779 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
KRT16P08779 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
KRT16P08779 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
KRT16P08779 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
KRT16P08779 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
KRT16P08779 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
KRT16P08779 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
KRT16P08779 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
KRT16P08779 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
KRT16P08779 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
KRT16P08779 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
KRT16P08779 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
KRT16P08779 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
KRT16P08779 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
KRT16P08779 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
KRT16P08779 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
KRT16P08779 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
KRT16P08779 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
KRT16P08779 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
KRT16P08779 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
KRT16P08779 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
KRT16P08779 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
KRT16P08779 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
KRT16P08779 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
KRT16P08779 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
KRT16P08779 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
KRT16P08779 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
KRT16P08779 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
KRT16P08779 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
KRT16P08779 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
KRT16P08779 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
KRT16P08779 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
KRT16P08779 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
KRT16P08779 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
KRT16P08779 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
KRT16P08779 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
KRT16P08779 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
KRT16P08779 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
KRT16P08779 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
KRT16P08779 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
KRT16P08779 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
KRT16P08779 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
KRT16P08779 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
KRT16P08779 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
KRT16P08779 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
KRT16P08779 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
KRT16P08779 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
KRT16P08779 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
KRT16P08779 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
KRT16P08779 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
KRT16P08779 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
KRT16P08779 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
KRT16P08779 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
KRT16P08779 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
KRT16P08779 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.7 ms