Protein–RNA interactions for Protein: P06401

PGR, Progesterone receptor, humanhuman

Predictions only

Length 933 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGRP06401 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PGRP06401 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PGRP06401 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PGRP06401 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PGRP06401 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
PGRP06401 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PGRP06401 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PGRP06401 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PGRP06401 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PGRP06401 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
PGRP06401 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PGRP06401 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PGRP06401 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PGRP06401 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
PGRP06401 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
PGRP06401 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PGRP06401 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
PGRP06401 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PGRP06401 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PGRP06401 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PGRP06401 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PGRP06401 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PGRP06401 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PGRP06401 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PGRP06401 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PGRP06401 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PGRP06401 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PGRP06401 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PGRP06401 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PGRP06401 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PGRP06401 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PGRP06401 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PGRP06401 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PGRP06401 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PGRP06401 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PGRP06401 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PGRP06401 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PGRP06401 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PGRP06401 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PGRP06401 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
PGRP06401 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PGRP06401 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PGRP06401 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
PGRP06401 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PGRP06401 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PGRP06401 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PGRP06401 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PGRP06401 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PGRP06401 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PGRP06401 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
PGRP06401 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PGRP06401 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PGRP06401 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PGRP06401 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PGRP06401 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PGRP06401 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PGRP06401 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
PGRP06401 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PGRP06401 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PGRP06401 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
PGRP06401 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PGRP06401 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PGRP06401 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PGRP06401 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PGRP06401 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PGRP06401 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PGRP06401 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PGRP06401 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PGRP06401 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC24■■□□□ 1.43
PGRP06401 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC24■■□□□ 1.43
PGRP06401 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
PGRP06401 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PGRP06401 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PGRP06401 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PGRP06401 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PGRP06401 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PGRP06401 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PGRP06401 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PGRP06401 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PGRP06401 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PGRP06401 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PGRP06401 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PGRP06401 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
PGRP06401 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PGRP06401 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PGRP06401 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PGRP06401 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PGRP06401 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PGRP06401 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PGRP06401 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PGRP06401 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PGRP06401 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
PGRP06401 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PGRP06401 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PGRP06401 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PGRP06401 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PGRP06401 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PGRP06401 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PGRP06401 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PGRP06401 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.7 ms