Protein–RNA interactions for Protein: P05231

IL6, Interleukin-6, humanhuman

Predictions only

Length 212 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IL6P05231 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
IL6P05231 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
IL6P05231 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
IL6P05231 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
IL6P05231 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
IL6P05231 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
IL6P05231 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
IL6P05231 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
IL6P05231 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
IL6P05231 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
IL6P05231 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
IL6P05231 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
IL6P05231 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
IL6P05231 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
IL6P05231 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
IL6P05231 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
IL6P05231 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
IL6P05231 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
IL6P05231 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
IL6P05231 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
IL6P05231 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
IL6P05231 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
IL6P05231 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
IL6P05231 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
IL6P05231 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
IL6P05231 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
IL6P05231 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
IL6P05231 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
IL6P05231 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
IL6P05231 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
IL6P05231 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
IL6P05231 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
IL6P05231 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
IL6P05231 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
IL6P05231 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
IL6P05231 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
IL6P05231 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
IL6P05231 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
IL6P05231 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
IL6P05231 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
IL6P05231 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
IL6P05231 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
IL6P05231 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
IL6P05231 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
IL6P05231 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
IL6P05231 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
IL6P05231 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
IL6P05231 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
IL6P05231 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
IL6P05231 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
IL6P05231 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
IL6P05231 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
IL6P05231 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
IL6P05231 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
IL6P05231 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
IL6P05231 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
IL6P05231 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
IL6P05231 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
IL6P05231 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
IL6P05231 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
IL6P05231 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
IL6P05231 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
IL6P05231 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
IL6P05231 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
IL6P05231 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
IL6P05231 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
IL6P05231 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
IL6P05231 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
IL6P05231 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
IL6P05231 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
IL6P05231 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
IL6P05231 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
IL6P05231 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC24■■□□□ 1.43
IL6P05231 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
IL6P05231 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
IL6P05231 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
IL6P05231 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
IL6P05231 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
IL6P05231 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
IL6P05231 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
IL6P05231 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
IL6P05231 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
IL6P05231 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
IL6P05231 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
IL6P05231 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
IL6P05231 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
IL6P05231 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
IL6P05231 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
IL6P05231 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
IL6P05231 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
IL6P05231 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
IL6P05231 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
IL6P05231 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
IL6P05231 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
IL6P05231 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
IL6P05231 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
IL6P05231 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
IL6P05231 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
IL6P05231 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
IL6P05231 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.7 ms