Protein–RNA interactions for Protein: O95970

LGI1, Leucine-rich glioma-inactivated protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 557 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LGI1O95970 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
LGI1O95970 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
LGI1O95970 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
LGI1O95970 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
LGI1O95970 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
LGI1O95970 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC23.45■■□□□ 1.34
LGI1O95970 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
LGI1O95970 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
LGI1O95970 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
LGI1O95970 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
LGI1O95970 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
LGI1O95970 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
LGI1O95970 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
LGI1O95970 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
LGI1O95970 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
LGI1O95970 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
LGI1O95970 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
LGI1O95970 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
LGI1O95970 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
LGI1O95970 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
LGI1O95970 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
LGI1O95970 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
LGI1O95970 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
LGI1O95970 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
LGI1O95970 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
LGI1O95970 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
LGI1O95970 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
LGI1O95970 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
LGI1O95970 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
LGI1O95970 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
LGI1O95970 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
LGI1O95970 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
LGI1O95970 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
LGI1O95970 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
LGI1O95970 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
LGI1O95970 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC23.39■■□□□ 1.34
LGI1O95970 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
LGI1O95970 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
LGI1O95970 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
LGI1O95970 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
LGI1O95970 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
LGI1O95970 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
LGI1O95970 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
LGI1O95970 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
LGI1O95970 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
LGI1O95970 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
LGI1O95970 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
LGI1O95970 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
LGI1O95970 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
LGI1O95970 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
LGI1O95970 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
LGI1O95970 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
LGI1O95970 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
LGI1O95970 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
LGI1O95970 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
LGI1O95970 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
LGI1O95970 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
LGI1O95970 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
LGI1O95970 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
LGI1O95970 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
LGI1O95970 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
LGI1O95970 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
LGI1O95970 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
LGI1O95970 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
LGI1O95970 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
LGI1O95970 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
LGI1O95970 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
LGI1O95970 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
LGI1O95970 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
LGI1O95970 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
LGI1O95970 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
LGI1O95970 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
LGI1O95970 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
LGI1O95970 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
LGI1O95970 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
LGI1O95970 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
LGI1O95970 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
LGI1O95970 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
LGI1O95970 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
LGI1O95970 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
LGI1O95970 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
LGI1O95970 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
LGI1O95970 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
LGI1O95970 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
LGI1O95970 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC23.26■■□□□ 1.31
LGI1O95970 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
LGI1O95970 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
LGI1O95970 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
LGI1O95970 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
LGI1O95970 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
LGI1O95970 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
LGI1O95970 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
LGI1O95970 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC23.25■■□□□ 1.31
LGI1O95970 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
LGI1O95970 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
LGI1O95970 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
LGI1O95970 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
LGI1O95970 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
LGI1O95970 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
LGI1O95970 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.2 ms