Protein–RNA interactions for Protein: O95721

SNAP29, Synaptosomal-associated protein 29, humanhuman

Predictions only

Length 258 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNAP29O95721 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SNAP29O95721 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SNAP29O95721 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SNAP29O95721 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SNAP29O95721 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SNAP29O95721 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SNAP29O95721 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SNAP29O95721 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
SNAP29O95721 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SNAP29O95721 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SNAP29O95721 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SNAP29O95721 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SNAP29O95721 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SNAP29O95721 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SNAP29O95721 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SNAP29O95721 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SNAP29O95721 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SNAP29O95721 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SNAP29O95721 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SNAP29O95721 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SNAP29O95721 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SNAP29O95721 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SNAP29O95721 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SNAP29O95721 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SNAP29O95721 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SNAP29O95721 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SNAP29O95721 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SNAP29O95721 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SNAP29O95721 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SNAP29O95721 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SNAP29O95721 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SNAP29O95721 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SNAP29O95721 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SNAP29O95721 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SNAP29O95721 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SNAP29O95721 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SNAP29O95721 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SNAP29O95721 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SNAP29O95721 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SNAP29O95721 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SNAP29O95721 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SNAP29O95721 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SNAP29O95721 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SNAP29O95721 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SNAP29O95721 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SNAP29O95721 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
SNAP29O95721 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
SNAP29O95721 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SNAP29O95721 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SNAP29O95721 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SNAP29O95721 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SNAP29O95721 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SNAP29O95721 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SNAP29O95721 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SNAP29O95721 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SNAP29O95721 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
SNAP29O95721 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SNAP29O95721 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SNAP29O95721 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SNAP29O95721 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SNAP29O95721 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SNAP29O95721 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SNAP29O95721 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SNAP29O95721 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SNAP29O95721 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SNAP29O95721 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SNAP29O95721 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SNAP29O95721 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SNAP29O95721 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SNAP29O95721 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SNAP29O95721 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SNAP29O95721 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SNAP29O95721 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SNAP29O95721 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SNAP29O95721 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SNAP29O95721 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SNAP29O95721 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SNAP29O95721 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SNAP29O95721 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SNAP29O95721 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
SNAP29O95721 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SNAP29O95721 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SNAP29O95721 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SNAP29O95721 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SNAP29O95721 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SNAP29O95721 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SNAP29O95721 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SNAP29O95721 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SNAP29O95721 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SNAP29O95721 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
SNAP29O95721 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
SNAP29O95721 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
SNAP29O95721 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC23.39■■□□□ 1.34
SNAP29O95721 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
SNAP29O95721 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
SNAP29O95721 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SNAP29O95721 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
SNAP29O95721 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SNAP29O95721 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SNAP29O95721 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 230.1 ms