Protein–RNA interactions for Protein: O95219

SNX4, Sorting nexin-4, humanhuman

Predictions only

Length 450 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX4O95219 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SNX4O95219 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SNX4O95219 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SNX4O95219 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SNX4O95219 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SNX4O95219 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SNX4O95219 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SNX4O95219 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SNX4O95219 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SNX4O95219 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SNX4O95219 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SNX4O95219 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SNX4O95219 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SNX4O95219 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SNX4O95219 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SNX4O95219 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
SNX4O95219 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
SNX4O95219 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
SNX4O95219 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SNX4O95219 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SNX4O95219 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SNX4O95219 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
SNX4O95219 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
SNX4O95219 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
SNX4O95219 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
SNX4O95219 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
SNX4O95219 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
SNX4O95219 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
SNX4O95219 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
SNX4O95219 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
SNX4O95219 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SNX4O95219 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SNX4O95219 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SNX4O95219 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
SNX4O95219 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SNX4O95219 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SNX4O95219 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SNX4O95219 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SNX4O95219 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
SNX4O95219 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
SNX4O95219 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SNX4O95219 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SNX4O95219 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SNX4O95219 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SNX4O95219 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SNX4O95219 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SNX4O95219 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SNX4O95219 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SNX4O95219 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SNX4O95219 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SNX4O95219 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SNX4O95219 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SNX4O95219 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SNX4O95219 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SNX4O95219 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
SNX4O95219 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SNX4O95219 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
SNX4O95219 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SNX4O95219 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SNX4O95219 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SNX4O95219 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SNX4O95219 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SNX4O95219 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SNX4O95219 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SNX4O95219 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
SNX4O95219 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SNX4O95219 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
SNX4O95219 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SNX4O95219 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SNX4O95219 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SNX4O95219 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SNX4O95219 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
SNX4O95219 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SNX4O95219 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SNX4O95219 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SNX4O95219 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
SNX4O95219 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SNX4O95219 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SNX4O95219 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SNX4O95219 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SNX4O95219 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SNX4O95219 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SNX4O95219 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SNX4O95219 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SNX4O95219 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SNX4O95219 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
SNX4O95219 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SNX4O95219 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SNX4O95219 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SNX4O95219 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SNX4O95219 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SNX4O95219 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SNX4O95219 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SNX4O95219 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SNX4O95219 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SNX4O95219 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
SNX4O95219 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SNX4O95219 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SNX4O95219 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SNX4O95219 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.2 ms