Protein–RNA interactions for Protein: O60939

SCN2B, Sodium channel subunit beta-2, humanhuman

Predictions only

Length 215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN2BO60939 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SCN2BO60939 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SCN2BO60939 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SCN2BO60939 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SCN2BO60939 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
SCN2BO60939 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SCN2BO60939 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SCN2BO60939 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SCN2BO60939 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SCN2BO60939 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SCN2BO60939 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SCN2BO60939 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SCN2BO60939 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SCN2BO60939 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SCN2BO60939 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SCN2BO60939 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SCN2BO60939 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
SCN2BO60939 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SCN2BO60939 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SCN2BO60939 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SCN2BO60939 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SCN2BO60939 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SCN2BO60939 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SCN2BO60939 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SCN2BO60939 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SCN2BO60939 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SCN2BO60939 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SCN2BO60939 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SCN2BO60939 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SCN2BO60939 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SCN2BO60939 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SCN2BO60939 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SCN2BO60939 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SCN2BO60939 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC24■■□□□ 1.43
SCN2BO60939 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SCN2BO60939 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SCN2BO60939 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
SCN2BO60939 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SCN2BO60939 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC24■■□□□ 1.43
SCN2BO60939 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SCN2BO60939 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SCN2BO60939 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SCN2BO60939 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SCN2BO60939 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
SCN2BO60939 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SCN2BO60939 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SCN2BO60939 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SCN2BO60939 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SCN2BO60939 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SCN2BO60939 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SCN2BO60939 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SCN2BO60939 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SCN2BO60939 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SCN2BO60939 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SCN2BO60939 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SCN2BO60939 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SCN2BO60939 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SCN2BO60939 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SCN2BO60939 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
SCN2BO60939 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SCN2BO60939 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SCN2BO60939 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
SCN2BO60939 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SCN2BO60939 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SCN2BO60939 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SCN2BO60939 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SCN2BO60939 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SCN2BO60939 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SCN2BO60939 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
SCN2BO60939 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SCN2BO60939 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SCN2BO60939 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SCN2BO60939 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SCN2BO60939 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SCN2BO60939 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SCN2BO60939 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
SCN2BO60939 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
SCN2BO60939 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SCN2BO60939 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SCN2BO60939 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SCN2BO60939 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SCN2BO60939 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SCN2BO60939 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
SCN2BO60939 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SCN2BO60939 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SCN2BO60939 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SCN2BO60939 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SCN2BO60939 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SCN2BO60939 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SCN2BO60939 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SCN2BO60939 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SCN2BO60939 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SCN2BO60939 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SCN2BO60939 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SCN2BO60939 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SCN2BO60939 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SCN2BO60939 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SCN2BO60939 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SCN2BO60939 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SCN2BO60939 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77.4 ms