Protein–RNA interactions for Protein: O43175

PHGDH, D-3-phosphoglycerate dehydrogenase, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 533 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHGDHO43175 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PHGDHO43175 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PHGDHO43175 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PHGDHO43175 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PHGDHO43175 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PHGDHO43175 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
PHGDHO43175 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
PHGDHO43175 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PHGDHO43175 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PHGDHO43175 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PHGDHO43175 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PHGDHO43175 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PHGDHO43175 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PHGDHO43175 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PHGDHO43175 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PHGDHO43175 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PHGDHO43175 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PHGDHO43175 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.63
PHGDHO43175 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
PHGDHO43175 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PHGDHO43175 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PHGDHO43175 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
PHGDHO43175 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
PHGDHO43175 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PHGDHO43175 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
PHGDHO43175 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PHGDHO43175 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PHGDHO43175 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PHGDHO43175 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PHGDHO43175 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PHGDHO43175 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PHGDHO43175 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PHGDHO43175 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PHGDHO43175 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
PHGDHO43175 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
PHGDHO43175 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
PHGDHO43175 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PHGDHO43175 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PHGDHO43175 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PHGDHO43175 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PHGDHO43175 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
PHGDHO43175 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC25.14■■□□□ 1.61
PHGDHO43175 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PHGDHO43175 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PHGDHO43175 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
PHGDHO43175 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PHGDHO43175 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
PHGDHO43175 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PHGDHO43175 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PHGDHO43175 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PHGDHO43175 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
PHGDHO43175 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC25.09■■□□□ 1.61
PHGDHO43175 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
PHGDHO43175 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
PHGDHO43175 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
PHGDHO43175 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
PHGDHO43175 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PHGDHO43175 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
PHGDHO43175 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PHGDHO43175 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
PHGDHO43175 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
PHGDHO43175 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
PHGDHO43175 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
PHGDHO43175 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
PHGDHO43175 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
PHGDHO43175 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
PHGDHO43175 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
PHGDHO43175 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PHGDHO43175 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PHGDHO43175 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
PHGDHO43175 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PHGDHO43175 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
PHGDHO43175 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
PHGDHO43175 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PHGDHO43175 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PHGDHO43175 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
PHGDHO43175 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PHGDHO43175 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PHGDHO43175 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
PHGDHO43175 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
PHGDHO43175 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PHGDHO43175 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PHGDHO43175 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PHGDHO43175 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PHGDHO43175 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PHGDHO43175 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PHGDHO43175 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PHGDHO43175 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PHGDHO43175 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PHGDHO43175 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
PHGDHO43175 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
PHGDHO43175 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC25.01■■□□□ 1.59
PHGDHO43175 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PHGDHO43175 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PHGDHO43175 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PHGDHO43175 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PHGDHO43175 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC25■■□□□ 1.59
PHGDHO43175 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PHGDHO43175 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
PHGDHO43175 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.9 ms