Protein–RNA interactions for Protein: O15446

CD3EAP, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA34, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 510 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD3EAPO15446 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CD3EAPO15446 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CD3EAPO15446 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CD3EAPO15446 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CD3EAPO15446 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CD3EAPO15446 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CD3EAPO15446 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CD3EAPO15446 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CD3EAPO15446 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CD3EAPO15446 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CD3EAPO15446 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
CD3EAPO15446 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CD3EAPO15446 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CD3EAPO15446 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CD3EAPO15446 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CD3EAPO15446 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CD3EAPO15446 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CD3EAPO15446 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CD3EAPO15446 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CD3EAPO15446 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CD3EAPO15446 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CD3EAPO15446 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CD3EAPO15446 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CD3EAPO15446 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CD3EAPO15446 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CD3EAPO15446 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CD3EAPO15446 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CD3EAPO15446 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
CD3EAPO15446 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CD3EAPO15446 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CD3EAPO15446 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CD3EAPO15446 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CD3EAPO15446 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CD3EAPO15446 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CD3EAPO15446 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CD3EAPO15446 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CD3EAPO15446 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CD3EAPO15446 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CD3EAPO15446 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CD3EAPO15446 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CD3EAPO15446 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CD3EAPO15446 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CD3EAPO15446 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CD3EAPO15446 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CD3EAPO15446 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CD3EAPO15446 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CD3EAPO15446 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CD3EAPO15446 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CD3EAPO15446 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CD3EAPO15446 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CD3EAPO15446 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CD3EAPO15446 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CD3EAPO15446 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CD3EAPO15446 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CD3EAPO15446 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CD3EAPO15446 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CD3EAPO15446 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CD3EAPO15446 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CD3EAPO15446 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CD3EAPO15446 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CD3EAPO15446 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CD3EAPO15446 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CD3EAPO15446 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CD3EAPO15446 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CD3EAPO15446 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.2■■□□□ 1.63
CD3EAPO15446 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.2■■□□□ 1.63
CD3EAPO15446 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
CD3EAPO15446 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CD3EAPO15446 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
CD3EAPO15446 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
CD3EAPO15446 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CD3EAPO15446 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CD3EAPO15446 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CD3EAPO15446 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CD3EAPO15446 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CD3EAPO15446 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CD3EAPO15446 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CD3EAPO15446 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CD3EAPO15446 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CD3EAPO15446 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CD3EAPO15446 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CD3EAPO15446 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CD3EAPO15446 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CD3EAPO15446 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CD3EAPO15446 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CD3EAPO15446 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CD3EAPO15446 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
CD3EAPO15446 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CD3EAPO15446 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CD3EAPO15446 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC25.14■■□□□ 1.61
CD3EAPO15446 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
CD3EAPO15446 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CD3EAPO15446 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CD3EAPO15446 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CD3EAPO15446 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
CD3EAPO15446 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CD3EAPO15446 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CD3EAPO15446 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CD3EAPO15446 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CD3EAPO15446 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.6 ms