Protein–RNA interactions for Protein: O15265

ATXN7, Ataxin-7, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 892 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATXN7O15265 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
ATXN7O15265 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
ATXN7O15265 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ATXN7O15265 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
ATXN7O15265 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
ATXN7O15265 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
ATXN7O15265 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ATXN7O15265 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
ATXN7O15265 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ATXN7O15265 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ATXN7O15265 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ATXN7O15265 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ATXN7O15265 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
ATXN7O15265 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ATXN7O15265 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ATXN7O15265 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
ATXN7O15265 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ATXN7O15265 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
ATXN7O15265 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ATXN7O15265 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ATXN7O15265 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
ATXN7O15265 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ATXN7O15265 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ATXN7O15265 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
ATXN7O15265 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
ATXN7O15265 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
ATXN7O15265 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ATXN7O15265 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ATXN7O15265 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ATXN7O15265 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ATXN7O15265 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ATXN7O15265 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ATXN7O15265 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ATXN7O15265 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
ATXN7O15265 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
ATXN7O15265 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
ATXN7O15265 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
ATXN7O15265 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
ATXN7O15265 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.37
ATXN7O15265 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ATXN7O15265 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ATXN7O15265 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
ATXN7O15265 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
ATXN7O15265 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
ATXN7O15265 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ATXN7O15265 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ATXN7O15265 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ATXN7O15265 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ATXN7O15265 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ATXN7O15265 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ATXN7O15265 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ATXN7O15265 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
ATXN7O15265 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ATXN7O15265 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ATXN7O15265 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
ATXN7O15265 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ATXN7O15265 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ATXN7O15265 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ATXN7O15265 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ATXN7O15265 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ATXN7O15265 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
ATXN7O15265 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ATXN7O15265 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
ATXN7O15265 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
ATXN7O15265 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ATXN7O15265 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
ATXN7O15265 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ATXN7O15265 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ATXN7O15265 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ATXN7O15265 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
ATXN7O15265 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
ATXN7O15265 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ATXN7O15265 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ATXN7O15265 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
ATXN7O15265 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
ATXN7O15265 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ATXN7O15265 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
ATXN7O15265 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
ATXN7O15265 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ATXN7O15265 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
ATXN7O15265 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
ATXN7O15265 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
ATXN7O15265 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ATXN7O15265 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ATXN7O15265 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
ATXN7O15265 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ATXN7O15265 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ATXN7O15265 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ATXN7O15265 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ATXN7O15265 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ATXN7O15265 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ATXN7O15265 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
ATXN7O15265 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ATXN7O15265 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
ATXN7O15265 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ATXN7O15265 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ATXN7O15265 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ATXN7O15265 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ATXN7O15265 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
ATXN7O15265 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 117.4 ms