Protein–RNA interactions for Protein: O15197

EPHB6, Ephrin type-B receptor 6, humanhuman

Predictions only

Length 1,021 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPHB6O15197 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
EPHB6O15197 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
EPHB6O15197 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
EPHB6O15197 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
EPHB6O15197 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
EPHB6O15197 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC27.56■■■□□ 2
EPHB6O15197 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
EPHB6O15197 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
EPHB6O15197 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
EPHB6O15197 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
EPHB6O15197 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
EPHB6O15197 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
EPHB6O15197 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
EPHB6O15197 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
EPHB6O15197 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
EPHB6O15197 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
EPHB6O15197 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
EPHB6O15197 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC27.51■■■□□ 2
EPHB6O15197 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
EPHB6O15197 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
EPHB6O15197 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
EPHB6O15197 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
EPHB6O15197 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
EPHB6O15197 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
EPHB6O15197 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
EPHB6O15197 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
EPHB6O15197 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
EPHB6O15197 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
EPHB6O15197 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
EPHB6O15197 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
EPHB6O15197 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
EPHB6O15197 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
EPHB6O15197 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
EPHB6O15197 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC27.45■■□□□ 1.99
EPHB6O15197 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC27.45■■□□□ 1.98
EPHB6O15197 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
EPHB6O15197 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
EPHB6O15197 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
EPHB6O15197 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
EPHB6O15197 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
EPHB6O15197 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
EPHB6O15197 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
EPHB6O15197 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
EPHB6O15197 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
EPHB6O15197 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
EPHB6O15197 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
EPHB6O15197 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
EPHB6O15197 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
EPHB6O15197 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
EPHB6O15197 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
EPHB6O15197 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
EPHB6O15197 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
EPHB6O15197 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
EPHB6O15197 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
EPHB6O15197 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
EPHB6O15197 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
EPHB6O15197 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
EPHB6O15197 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
EPHB6O15197 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
EPHB6O15197 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
EPHB6O15197 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC27.37■■□□□ 1.97
EPHB6O15197 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
EPHB6O15197 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
EPHB6O15197 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
EPHB6O15197 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
EPHB6O15197 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
EPHB6O15197 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
EPHB6O15197 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
EPHB6O15197 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
EPHB6O15197 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
EPHB6O15197 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
EPHB6O15197 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
EPHB6O15197 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
EPHB6O15197 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
EPHB6O15197 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
EPHB6O15197 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
EPHB6O15197 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC27.34■■□□□ 1.97
EPHB6O15197 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
EPHB6O15197 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
EPHB6O15197 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
EPHB6O15197 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
EPHB6O15197 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
EPHB6O15197 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
EPHB6O15197 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
EPHB6O15197 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
EPHB6O15197 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
EPHB6O15197 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
EPHB6O15197 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
EPHB6O15197 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
EPHB6O15197 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
EPHB6O15197 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
EPHB6O15197 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
EPHB6O15197 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC27.3■■□□□ 1.96
EPHB6O15197 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC27.3■■□□□ 1.96
EPHB6O15197 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
EPHB6O15197 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
EPHB6O15197 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC27.29■■□□□ 1.96
EPHB6O15197 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC27.29■■□□□ 1.96
EPHB6O15197 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
EPHB6O15197 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.6 ms