Protein–RNA interactions for Protein: O15049

N4BP3, NEDD4-binding protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 544 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
N4BP3O15049 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
N4BP3O15049 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
N4BP3O15049 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
N4BP3O15049 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
N4BP3O15049 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
N4BP3O15049 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
N4BP3O15049 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
N4BP3O15049 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
N4BP3O15049 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC28.38■■■□□ 2.13
N4BP3O15049 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
N4BP3O15049 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
N4BP3O15049 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
N4BP3O15049 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
N4BP3O15049 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
N4BP3O15049 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC28.37■■■□□ 2.13
N4BP3O15049 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC28.37■■■□□ 2.13
N4BP3O15049 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
N4BP3O15049 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
N4BP3O15049 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
N4BP3O15049 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
N4BP3O15049 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
N4BP3O15049 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
N4BP3O15049 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
N4BP3O15049 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
N4BP3O15049 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
N4BP3O15049 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
N4BP3O15049 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC28.33■■■□□ 2.13
N4BP3O15049 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC28.33■■■□□ 2.13
N4BP3O15049 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
N4BP3O15049 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
N4BP3O15049 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
N4BP3O15049 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
N4BP3O15049 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
N4BP3O15049 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
N4BP3O15049 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
N4BP3O15049 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
N4BP3O15049 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
N4BP3O15049 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
N4BP3O15049 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
N4BP3O15049 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
N4BP3O15049 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
N4BP3O15049 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
N4BP3O15049 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
N4BP3O15049 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
N4BP3O15049 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
N4BP3O15049 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
N4BP3O15049 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
N4BP3O15049 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
N4BP3O15049 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
N4BP3O15049 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
N4BP3O15049 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
N4BP3O15049 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
N4BP3O15049 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
N4BP3O15049 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
N4BP3O15049 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
N4BP3O15049 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
N4BP3O15049 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
N4BP3O15049 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
N4BP3O15049 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
N4BP3O15049 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
N4BP3O15049 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
N4BP3O15049 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
N4BP3O15049 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
N4BP3O15049 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
N4BP3O15049 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
N4BP3O15049 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
N4BP3O15049 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.12
N4BP3O15049 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
N4BP3O15049 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
N4BP3O15049 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
N4BP3O15049 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
N4BP3O15049 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
N4BP3O15049 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
N4BP3O15049 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
N4BP3O15049 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
N4BP3O15049 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC28.25■■■□□ 2.11
N4BP3O15049 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC28.25■■■□□ 2.11
N4BP3O15049 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
N4BP3O15049 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
N4BP3O15049 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
N4BP3O15049 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
N4BP3O15049 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC28.24■■■□□ 2.11
N4BP3O15049 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
N4BP3O15049 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
N4BP3O15049 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
N4BP3O15049 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
N4BP3O15049 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
N4BP3O15049 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
N4BP3O15049 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
N4BP3O15049 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
N4BP3O15049 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
N4BP3O15049 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
N4BP3O15049 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
N4BP3O15049 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
N4BP3O15049 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
N4BP3O15049 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
N4BP3O15049 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
N4BP3O15049 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
N4BP3O15049 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
N4BP3O15049 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.9 ms