Protein–RNA interactions for Protein: H3BNX3

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 289 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H3BNX3 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
H3BNX3 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
H3BNX3 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
H3BNX3 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
H3BNX3 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
H3BNX3 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
H3BNX3 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
H3BNX3 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
H3BNX3 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
H3BNX3 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
H3BNX3 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
H3BNX3 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
H3BNX3 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
H3BNX3 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
H3BNX3 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
H3BNX3 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
H3BNX3 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
H3BNX3 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
H3BNX3 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
H3BNX3 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
H3BNX3 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
H3BNX3 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
H3BNX3 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
H3BNX3 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.43
H3BNX3 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
H3BNX3 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
H3BNX3 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
H3BNX3 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
H3BNX3 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
H3BNX3 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
H3BNX3 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
H3BNX3 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
H3BNX3 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
H3BNX3 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
H3BNX3 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
H3BNX3 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
H3BNX3 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
H3BNX3 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
H3BNX3 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
H3BNX3 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
H3BNX3 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
H3BNX3 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
H3BNX3 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
H3BNX3 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
H3BNX3 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
H3BNX3 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
H3BNX3 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
H3BNX3 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
H3BNX3 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
H3BNX3 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
H3BNX3 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
H3BNX3 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
H3BNX3 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
H3BNX3 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
H3BNX3 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
H3BNX3 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
H3BNX3 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
H3BNX3 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
H3BNX3 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
H3BNX3 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
H3BNX3 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
H3BNX3 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
H3BNX3 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
H3BNX3 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
H3BNX3 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
H3BNX3 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
H3BNX3 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
H3BNX3 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
H3BNX3 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
H3BNX3 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
H3BNX3 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
H3BNX3 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
H3BNX3 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
H3BNX3 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
H3BNX3 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
H3BNX3 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
H3BNX3 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
H3BNX3 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
H3BNX3 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
H3BNX3 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
H3BNX3 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
H3BNX3 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
H3BNX3 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
H3BNX3 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
H3BNX3 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
H3BNX3 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
H3BNX3 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
H3BNX3 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
H3BNX3 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
H3BNX3 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
H3BNX3 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
H3BNX3 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
H3BNX3 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
H3BNX3 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
H3BNX3 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
H3BNX3 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
H3BNX3 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
H3BNX3 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
H3BNX3 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
H3BNX3 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.2 ms