Protein–RNA interactions for Protein: B7ZW38

HNRNPCL3, Heterogeneous nuclear ribonucleoprotein C-like 3, humanhuman

Predictions only

Length 293 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HNRNPCL3B7ZW38 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
HNRNPCL3B7ZW38 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
HNRNPCL3B7ZW38 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
HNRNPCL3B7ZW38 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
HNRNPCL3B7ZW38 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
HNRNPCL3B7ZW38 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
HNRNPCL3B7ZW38 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
HNRNPCL3B7ZW38 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
HNRNPCL3B7ZW38 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
HNRNPCL3B7ZW38 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
HNRNPCL3B7ZW38 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
HNRNPCL3B7ZW38 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
HNRNPCL3B7ZW38 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
HNRNPCL3B7ZW38 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
HNRNPCL3B7ZW38 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
HNRNPCL3B7ZW38 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
HNRNPCL3B7ZW38 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
HNRNPCL3B7ZW38 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
HNRNPCL3B7ZW38 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.35
HNRNPCL3B7ZW38 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
HNRNPCL3B7ZW38 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
HNRNPCL3B7ZW38 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
HNRNPCL3B7ZW38 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC23.5■■□□□ 1.35
HNRNPCL3B7ZW38 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
HNRNPCL3B7ZW38 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
HNRNPCL3B7ZW38 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
HNRNPCL3B7ZW38 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
HNRNPCL3B7ZW38 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
HNRNPCL3B7ZW38 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
HNRNPCL3B7ZW38 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
HNRNPCL3B7ZW38 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
HNRNPCL3B7ZW38 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
HNRNPCL3B7ZW38 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
HNRNPCL3B7ZW38 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
HNRNPCL3B7ZW38 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC23.47■■□□□ 1.35
HNRNPCL3B7ZW38 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
HNRNPCL3B7ZW38 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
HNRNPCL3B7ZW38 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
HNRNPCL3B7ZW38 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
HNRNPCL3B7ZW38 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
HNRNPCL3B7ZW38 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
HNRNPCL3B7ZW38 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
HNRNPCL3B7ZW38 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
HNRNPCL3B7ZW38 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
HNRNPCL3B7ZW38 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
HNRNPCL3B7ZW38 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
HNRNPCL3B7ZW38 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
HNRNPCL3B7ZW38 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
HNRNPCL3B7ZW38 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
HNRNPCL3B7ZW38 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
HNRNPCL3B7ZW38 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
HNRNPCL3B7ZW38 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
HNRNPCL3B7ZW38 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
HNRNPCL3B7ZW38 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
HNRNPCL3B7ZW38 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
HNRNPCL3B7ZW38 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
HNRNPCL3B7ZW38 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
HNRNPCL3B7ZW38 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
HNRNPCL3B7ZW38 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
HNRNPCL3B7ZW38 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
HNRNPCL3B7ZW38 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
HNRNPCL3B7ZW38 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
HNRNPCL3B7ZW38 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
HNRNPCL3B7ZW38 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
HNRNPCL3B7ZW38 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
HNRNPCL3B7ZW38 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
HNRNPCL3B7ZW38 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
HNRNPCL3B7ZW38 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
HNRNPCL3B7ZW38 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
HNRNPCL3B7ZW38 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
HNRNPCL3B7ZW38 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
HNRNPCL3B7ZW38 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
HNRNPCL3B7ZW38 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
HNRNPCL3B7ZW38 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
HNRNPCL3B7ZW38 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
HNRNPCL3B7ZW38 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
HNRNPCL3B7ZW38 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
HNRNPCL3B7ZW38 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC23.38■■□□□ 1.33
HNRNPCL3B7ZW38 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
HNRNPCL3B7ZW38 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
HNRNPCL3B7ZW38 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
HNRNPCL3B7ZW38 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
HNRNPCL3B7ZW38 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
HNRNPCL3B7ZW38 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
HNRNPCL3B7ZW38 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
HNRNPCL3B7ZW38 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
HNRNPCL3B7ZW38 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
HNRNPCL3B7ZW38 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
HNRNPCL3B7ZW38 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
HNRNPCL3B7ZW38 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
HNRNPCL3B7ZW38 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
HNRNPCL3B7ZW38 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
HNRNPCL3B7ZW38 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
HNRNPCL3B7ZW38 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
HNRNPCL3B7ZW38 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
HNRNPCL3B7ZW38 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
HNRNPCL3B7ZW38 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
HNRNPCL3B7ZW38 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
HNRNPCL3B7ZW38 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
HNRNPCL3B7ZW38 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 1167.2 ms