Protein–RNA interactions for Protein: A0A087X0B3

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 334 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A0A087X0B3 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
A0A087X0B3 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
A0A087X0B3 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
A0A087X0B3 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
A0A087X0B3 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
A0A087X0B3 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
A0A087X0B3 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
A0A087X0B3 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
A0A087X0B3 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC28.61■■■□□ 2.17
A0A087X0B3 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
A0A087X0B3 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC28.61■■■□□ 2.17
A0A087X0B3 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
A0A087X0B3 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
A0A087X0B3 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
A0A087X0B3 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
A0A087X0B3 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
A0A087X0B3 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
A0A087X0B3 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
A0A087X0B3 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
A0A087X0B3 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
A0A087X0B3 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
A0A087X0B3 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
A0A087X0B3 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
A0A087X0B3 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
A0A087X0B3 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
A0A087X0B3 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
A0A087X0B3 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
A0A087X0B3 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
A0A087X0B3 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
A0A087X0B3 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
A0A087X0B3 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
A0A087X0B3 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
A0A087X0B3 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
A0A087X0B3 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
A0A087X0B3 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
A0A087X0B3 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC28.53■■■□□ 2.16
A0A087X0B3 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
A0A087X0B3 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC28.53■■■□□ 2.16
A0A087X0B3 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
A0A087X0B3 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
A0A087X0B3 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
A0A087X0B3 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
A0A087X0B3 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
A0A087X0B3 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
A0A087X0B3 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
A0A087X0B3 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
A0A087X0B3 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
A0A087X0B3 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
A0A087X0B3 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
A0A087X0B3 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
A0A087X0B3 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
A0A087X0B3 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
A0A087X0B3 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
A0A087X0B3 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
A0A087X0B3 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
A0A087X0B3 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
A0A087X0B3 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
A0A087X0B3 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
A0A087X0B3 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
A0A087X0B3 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC28.47■■■□□ 2.15
A0A087X0B3 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
A0A087X0B3 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
A0A087X0B3 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC28.47■■■□□ 2.15
A0A087X0B3 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
A0A087X0B3 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
A0A087X0B3 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
A0A087X0B3 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
A0A087X0B3 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
A0A087X0B3 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
A0A087X0B3 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
A0A087X0B3 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
A0A087X0B3 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.15
A0A087X0B3 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
A0A087X0B3 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC28.45■■■□□ 2.15
A0A087X0B3 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC28.45■■■□□ 2.14
A0A087X0B3 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
A0A087X0B3 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
A0A087X0B3 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
A0A087X0B3 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
A0A087X0B3 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
A0A087X0B3 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
A0A087X0B3 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
A0A087X0B3 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
A0A087X0B3 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
A0A087X0B3 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
A0A087X0B3 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
A0A087X0B3 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
A0A087X0B3 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
A0A087X0B3 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
A0A087X0B3 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
A0A087X0B3 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
A0A087X0B3 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
A0A087X0B3 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
A0A087X0B3 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC28.38■■■□□ 2.13
A0A087X0B3 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC28.38■■■□□ 2.13
A0A087X0B3 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC28.38■■■□□ 2.13
A0A087X0B3 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
A0A087X0B3 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
A0A087X0B3 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
A0A087X0B3 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.2 ms