Protein–RNA interactions for Protein: Q3C1V9

Putative uncharacterized protein ENSP00000334305, humanhuman

Predictions only

Length 767 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3C1V9 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.1
Q3C1V9 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Q3C1V9 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Q3C1V9 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
Q3C1V9 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
Q3C1V9 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Q3C1V9 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Q3C1V9 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Q3C1V9 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Q3C1V9 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Q3C1V9 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Q3C1V9 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Q3C1V9 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Q3C1V9 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Q3C1V9 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Q3C1V9 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Q3C1V9 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Q3C1V9 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Q3C1V9 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Q3C1V9 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Q3C1V9 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Q3C1V9 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Q3C1V9 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Q3C1V9 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Q3C1V9 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Q3C1V9 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Q3C1V9 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Q3C1V9 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Q3C1V9 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Q3C1V9 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Q3C1V9 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Q3C1V9 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Q3C1V9 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Q3C1V9 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Q3C1V9 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Q3C1V9 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Q3C1V9 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Q3C1V9 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Q3C1V9 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Q3C1V9 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Q3C1V9 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Q3C1V9 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Q3C1V9 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Q3C1V9 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Q3C1V9 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Q3C1V9 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Q3C1V9 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Q3C1V9 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Q3C1V9 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Q3C1V9 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Q3C1V9 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Q3C1V9 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Q3C1V9 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Q3C1V9 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Q3C1V9 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Q3C1V9 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Q3C1V9 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Q3C1V9 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Q3C1V9 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Q3C1V9 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Q3C1V9 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Q3C1V9 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Q3C1V9 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Q3C1V9 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Q3C1V9 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Q3C1V9 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Q3C1V9 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Q3C1V9 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Q3C1V9 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Q3C1V9 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Q3C1V9 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Q3C1V9 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Q3C1V9 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Q3C1V9 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Q3C1V9 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Q3C1V9 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Q3C1V9 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Q3C1V9 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Q3C1V9 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Q3C1V9 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Q3C1V9 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Q3C1V9 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Q3C1V9 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Q3C1V9 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Q3C1V9 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Q3C1V9 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Q3C1V9 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Q3C1V9 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Q3C1V9 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Q3C1V9 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Q3C1V9 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Q3C1V9 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Q3C1V9 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Q3C1V9 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Q3C1V9 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Q3C1V9 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Q3C1V9 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Q3C1V9 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Q3C1V9 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Q3C1V9 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.6 ms