RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000303142.10

C20orf196-201, Transcript of Uncharacterized protein C20orf196, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene C20orf196, Length 1,154 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C20orf196-201ENST00000303142 NISCHQ9Y2I1 1504 aa44.96■■■■■ 4.79
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C20orf196-201ENST00000303142 NACADO15069 1562 aa37.85■■■■□ 3.65
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C20orf196-201ENST00000303142 MYO15BQ96JP2 1530 aa37.55■■■■□ 3.6
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C20orf196-201ENST00000303142 UNC13AQ9UPW8 1703 aa36.93■■■■□ 3.5
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C20orf196-201ENST00000303142 DNAJC5BQ9UF47 199 aa36.54■■■■□ 3.44
C20orf196-201ENST00000303142 SCRIBQ14160 1630 aa36.53■■■■□ 3.44
C20orf196-201ENST00000303142 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa36.5■■■■□ 3.43
C20orf196-201ENST00000303142 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP35.84■■■■□ 3.33
C20orf196-201ENST00000303142 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa35.75■■■■□ 3.31
C20orf196-201ENST00000303142 CECR2Q9BXF3 1484 aa35.61■■■■□ 3.29
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C20orf196-201ENST00000303142 NCAPD3P42695 1498 aa34.92■■■■□ 3.18
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C20orf196-201ENST00000303142 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa34.85■■■■□ 3.17
C20orf196-201ENST00000303142 SMARCA2P51531 1590 aa34.85■■■■□ 3.17
C20orf196-201ENST00000303142 HMGXB3Q12766 1538 aa34.71■■■■□ 3.15
C20orf196-201ENST00000303142 PEG3Q9GZU2 1588 aa34.64■■■■□ 3.14
C20orf196-201ENST00000303142 MROH2BQ7Z745 1585 aa34.6■■■■□ 3.13
C20orf196-201ENST00000303142 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP34.58■■■■□ 3.13
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C20orf196-201ENST00000303142 WIZO95785 1651 aa34.18■■■■□ 3.06
C20orf196-201ENST00000303142 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP34.12■■■■□ 3.05
C20orf196-201ENST00000303142 NESP48681 1621 aa34.08■■■■□ 3.05
C20orf196-201ENST00000303142 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa34.06■■■■□ 3.04
C20orf196-201ENST00000303142 CUX2O14529 1486 aa33.96■■■■□ 3.03
C20orf196-201ENST00000303142 CADPSQ9ULU8 1353 aa33.89■■■■□ 3.02
C20orf196-201ENST00000303142 PDS5BQ9NTI5 1447 aa33.88■■■■□ 3.01
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C20orf196-201ENST00000303142 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa33.67■■■□□ 2.98
C20orf196-201ENST00000303142 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP33.66■■■□□ 2.98
C20orf196-201ENST00000303142 CFTRP13569 1480 aa33.61■■■□□ 2.97
C20orf196-201ENST00000303142 MRC2Q9UBG0 1479 aa33.5■■■□□ 2.95
C20orf196-201ENST00000303142 CEP164Q9UPV0 1460 aa33.49■■■□□ 2.95
C20orf196-201ENST00000303142 FANCD2Q9BXW9 1451 aa33.48■■■□□ 2.95
C20orf196-201ENST00000303142 CCDC88BA6NC98 1476 aa33.45■■■□□ 2.95
C20orf196-201ENST00000303142 WDR62O43379 1518 aa33.38■■■□□ 2.93
C20orf196-201ENST00000303142 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa33.3■■■□□ 2.92
C20orf196-201ENST00000303142 PRDM2Q13029 1718 aa33.25■■■□□ 2.91
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C20orf196-201ENST00000303142 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP33■■■□□ 2.87
C20orf196-201ENST00000303142 ABCC8Q09428 1581 aa32.97■■■□□ 2.87
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C20orf196-201ENST00000303142 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP32.6■■■□□ 2.81
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C20orf196-201ENST00000303142 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP32.48■■■□□ 2.79
C20orf196-201ENST00000303142 FGD5Q6ZNL6 1462 aa32.46■■■□□ 2.79
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C20orf196-201ENST00000303142 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP32.22■■■□□ 2.75
C20orf196-201ENST00000303142 GRIN2BQ13224 1484 aa32.16■■■□□ 2.74
C20orf196-201ENST00000303142 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa32.16■■■□□ 2.74
C20orf196-201ENST00000303142 TOP2BQ02880 1626 aa32.15■■■□□ 2.74
C20orf196-201ENST00000303142 FBLN2P98095 1184 aa32.14■■■□□ 2.74
C20orf196-201ENST00000303142 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa32.13■■■□□ 2.73
C20orf196-201ENST00000303142 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP32.12■■■□□ 2.73
C20orf196-201ENST00000303142 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa32.11■■■□□ 2.73
C20orf196-201ENST00000303142 GAPVD1Q14C86 1478 aa32.1■■■□□ 2.73
C20orf196-201ENST00000303142 CHD1O14646 1710 aa32.09■■■□□ 2.73
C20orf196-201ENST00000303142 SYNJ1O43426 1573 aa32.07■■■□□ 2.72
C20orf196-201ENST00000303142 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP32.04■■■□□ 2.72
C20orf196-201ENST00000303142 TRIM41Q8WV44 630 aa32.02■■■□□ 2.72
C20orf196-201ENST00000303142 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa32.01■■■□□ 2.72
C20orf196-201ENST00000303142 SYNJ2O15056 1496 aa31.98■■■□□ 2.71
C20orf196-201ENST00000303142 PBRM1Q86U86 1689 aa31.98■■■□□ 2.71
C20orf196-201ENST00000303142 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa31.92■■■□□ 2.7
C20orf196-201ENST00000303142 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa31.92■■■□□ 2.7
C20orf196-201ENST00000303142 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa31.92■■■□□ 2.7
C20orf196-201ENST00000303142 ARHGEF11O15085 1522 aa31.91■■■□□ 2.7
C20orf196-201ENST00000303142 CLASP1Q7Z460 1538 aa31.8■■■□□ 2.68
C20orf196-201ENST00000303142 ERICH3Q5RHP9 1530 aa31.79■■■□□ 2.68
C20orf196-201ENST00000303142 FHAD1B1AJZ9 1412 aa31.74■■■□□ 2.67
C20orf196-201ENST00000303142 ADAMTS12P58397 1594 aa31.73■■■□□ 2.67
C20orf196-201ENST00000303142 GRIN2AQ12879 1464 aa31.72■■■□□ 2.67
C20orf196-201ENST00000303142 CYB5RLQ6IPT4 315 aa31.66■■■□□ 2.66
C20orf196-201ENST00000303142 ARAP1Q96P48 1450 aa31.61■■■□□ 2.65
C20orf196-201ENST00000303142 KIF27Q86VH2 1401 aa31.6■■■□□ 2.65
C20orf196-201ENST00000303142 NUP160Q12769 1436 aa31.59■■■□□ 2.65
C20orf196-201ENST00000303142 CEP170Q5SW79 1584 aa31.51■■■□□ 2.64
C20orf196-201ENST00000303142 IGF1RP08069 1367 aa31.46■■■□□ 2.63
C20orf196-201ENST00000303142 CUL7Q14999 1698 aa31.42■■■□□ 2.62
C20orf196-201ENST00000303142 SHROOM2Q13796 1616 aa31.36■■■□□ 2.61
C20orf196-201ENST00000303142 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa31.3■■■□□ 2.6
C20orf196-201ENST00000303142 JPH4Q96JJ6 628 aa31.29■■■□□ 2.6
C20orf196-201ENST00000303142 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa31.28■■■□□ 2.6
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