Protein–RNA interactions for Protein: Q16394

EXT1, Exostosin-1, humanhuman

Predictions only

Length 746 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EXT1Q16394 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
EXT1Q16394 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
EXT1Q16394 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
EXT1Q16394 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
EXT1Q16394 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
EXT1Q16394 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
EXT1Q16394 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
EXT1Q16394 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
EXT1Q16394 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
EXT1Q16394 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
EXT1Q16394 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
EXT1Q16394 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
EXT1Q16394 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.7■□□□□ 0.42
EXT1Q16394 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
EXT1Q16394 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
EXT1Q16394 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
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EXT1Q16394 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
EXT1Q16394 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
EXT1Q16394 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
EXT1Q16394 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
EXT1Q16394 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
EXT1Q16394 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
EXT1Q16394 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
EXT1Q16394 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
EXT1Q16394 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
EXT1Q16394 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
EXT1Q16394 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
EXT1Q16394 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
EXT1Q16394 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
EXT1Q16394 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
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EXT1Q16394 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
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EXT1Q16394 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
EXT1Q16394 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
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EXT1Q16394 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
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EXT1Q16394 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
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EXT1Q16394 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
EXT1Q16394 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
EXT1Q16394 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
EXT1Q16394 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
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EXT1Q16394 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
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EXT1Q16394 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
EXT1Q16394 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
EXT1Q16394 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
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EXT1Q16394 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
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EXT1Q16394 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC17.67■□□□□ 0.42
EXT1Q16394 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
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EXT1Q16394 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
EXT1Q16394 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
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