Protein–RNA interactions for Protein: J3KRW8

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 73 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
J3KRW8 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
J3KRW8 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
J3KRW8 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
J3KRW8 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
J3KRW8 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
J3KRW8 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.09
J3KRW8 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
J3KRW8 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
J3KRW8 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
J3KRW8 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
J3KRW8 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
J3KRW8 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
J3KRW8 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.52□□□□□ -0.09
J3KRW8 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
J3KRW8 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
J3KRW8 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
J3KRW8 ORAI2-205ENST00000478730 5531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
J3KRW8 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
J3KRW8 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
J3KRW8 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
J3KRW8 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
J3KRW8 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
J3KRW8 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
J3KRW8 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
J3KRW8 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
J3KRW8 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
J3KRW8 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
J3KRW8 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
J3KRW8 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
J3KRW8 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
J3KRW8 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
J3KRW8 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC14.51□□□□□ -0.09
J3KRW8 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
J3KRW8 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC14.51□□□□□ -0.09
J3KRW8 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
J3KRW8 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
J3KRW8 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
J3KRW8 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
J3KRW8 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
J3KRW8 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
J3KRW8 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
J3KRW8 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
J3KRW8 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
J3KRW8 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
J3KRW8 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
J3KRW8 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
J3KRW8 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
J3KRW8 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
J3KRW8 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
J3KRW8 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
J3KRW8 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
J3KRW8 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
J3KRW8 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
J3KRW8 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
J3KRW8 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
J3KRW8 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
J3KRW8 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
J3KRW8 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
J3KRW8 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
J3KRW8 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
J3KRW8 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
J3KRW8 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
J3KRW8 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
J3KRW8 AHR-201ENST00000242057 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
J3KRW8 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
J3KRW8 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
J3KRW8 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
J3KRW8 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
J3KRW8 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
J3KRW8 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
J3KRW8 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
J3KRW8 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
J3KRW8 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC14.5□□□□□ -0.09
J3KRW8 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
J3KRW8 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
J3KRW8 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
J3KRW8 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
J3KRW8 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
J3KRW8 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
J3KRW8 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
J3KRW8 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
J3KRW8 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
J3KRW8 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
J3KRW8 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
J3KRW8 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
J3KRW8 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
J3KRW8 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
J3KRW8 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
J3KRW8 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
J3KRW8 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
J3KRW8 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
J3KRW8 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
J3KRW8 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
J3KRW8 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
J3KRW8 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
J3KRW8 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
J3KRW8 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
J3KRW8 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
J3KRW8 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
J3KRW8 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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