Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRG1

VPS25, Vacuolar protein-sorting-associated protein 25, humanhuman

Predictions only

Length 176 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS25Q9BRG1 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
VPS25Q9BRG1 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
VPS25Q9BRG1 ZNF628-203ENST00000598519 3847 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
VPS25Q9BRG1 TJP2-212ENST00000636438 4689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
VPS25Q9BRG1 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
VPS25Q9BRG1 AC074117.1-201ENST00000447070 3060 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
VPS25Q9BRG1 PLEKHN1-201ENST00000379407 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
VPS25Q9BRG1 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
VPS25Q9BRG1 SPAG9-222ENST00000618113 8246 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
VPS25Q9BRG1 IGSF1-204ENST00000370903 4594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
VPS25Q9BRG1 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
VPS25Q9BRG1 VWF-201ENST00000261405 8838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
VPS25Q9BRG1 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
VPS25Q9BRG1 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
VPS25Q9BRG1 KCNMA1-251ENST00000639090 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
VPS25Q9BRG1 MAP3K1-201ENST00000399503 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
VPS25Q9BRG1 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
VPS25Q9BRG1 MASTL-203ENST00000375946 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
VPS25Q9BRG1 PBX3-204ENST00000373489 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
VPS25Q9BRG1 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
VPS25Q9BRG1 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
VPS25Q9BRG1 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
VPS25Q9BRG1 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
VPS25Q9BRG1 MCF2L2-208ENST00000473233 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
VPS25Q9BRG1 SLC4A3-201ENST00000273063 4246 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
VPS25Q9BRG1 HDAC5-202ENST00000336057 5040 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
VPS25Q9BRG1 TBC1D10B-201ENST00000409939 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
VPS25Q9BRG1 AC138028.2-202ENST00000567968 4528 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
VPS25Q9BRG1 BRF1-206ENST00000446501 2858 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
VPS25Q9BRG1 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
VPS25Q9BRG1 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
VPS25Q9BRG1 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
VPS25Q9BRG1 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
VPS25Q9BRG1 TMEM57-202ENST00000399766 3294 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
VPS25Q9BRG1 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
VPS25Q9BRG1 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
VPS25Q9BRG1 AFTPH-202ENST00000238856 4040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
VPS25Q9BRG1 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
VPS25Q9BRG1 EPHA2-201ENST00000358432 3964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
VPS25Q9BRG1 PITPNM3-201ENST00000262483 7086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
VPS25Q9BRG1 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
VPS25Q9BRG1 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
VPS25Q9BRG1 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
VPS25Q9BRG1 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
VPS25Q9BRG1 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
VPS25Q9BRG1 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
VPS25Q9BRG1 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
VPS25Q9BRG1 PTPN13-203ENST00000427191 8487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
VPS25Q9BRG1 FDX1-201ENST00000260270 3206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
VPS25Q9BRG1 EXOG-201ENST00000287675 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
VPS25Q9BRG1 DGKZ-201ENST00000318201 3213 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
VPS25Q9BRG1 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
VPS25Q9BRG1 MTA1-203ENST00000406191 2770 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
VPS25Q9BRG1 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
VPS25Q9BRG1 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
VPS25Q9BRG1 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
VPS25Q9BRG1 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
VPS25Q9BRG1 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
VPS25Q9BRG1 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
VPS25Q9BRG1 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
VPS25Q9BRG1 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
VPS25Q9BRG1 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
VPS25Q9BRG1 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
VPS25Q9BRG1 TMEM200C-202ENST00000581347 10638 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
VPS25Q9BRG1 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
VPS25Q9BRG1 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
VPS25Q9BRG1 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
VPS25Q9BRG1 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
VPS25Q9BRG1 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
VPS25Q9BRG1 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
VPS25Q9BRG1 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
VPS25Q9BRG1 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
VPS25Q9BRG1 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
VPS25Q9BRG1 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
VPS25Q9BRG1 ABCG5-202ENST00000405322 2896 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
VPS25Q9BRG1 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
VPS25Q9BRG1 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
VPS25Q9BRG1 KRT15-201ENST00000254043 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
VPS25Q9BRG1 MAPK8IP2-202ENST00000329492 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
VPS25Q9BRG1 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
VPS25Q9BRG1 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
VPS25Q9BRG1 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
VPS25Q9BRG1 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
VPS25Q9BRG1 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
VPS25Q9BRG1 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
VPS25Q9BRG1 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
VPS25Q9BRG1 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
VPS25Q9BRG1 EIF4G1-209ENST00000414031 5569 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
VPS25Q9BRG1 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
VPS25Q9BRG1 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
VPS25Q9BRG1 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
VPS25Q9BRG1 USP19-203ENST00000398892 4622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
VPS25Q9BRG1 CHD4-201ENST00000357008 6496 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
VPS25Q9BRG1 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
VPS25Q9BRG1 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
VPS25Q9BRG1 NR4A3-201ENST00000330847 4982 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
VPS25Q9BRG1 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
VPS25Q9BRG1 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
VPS25Q9BRG1 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
VPS25Q9BRG1 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 86 ms